Publicação
Análise Bioinformática da Via Hedgehog em Cancros Humanos: Expressão, Metilação e Impacto Prognóstico no KIRC e LGG
| datacite.subject.fos | Ciências Médicas | |
| datacite.subject.sdg | 03:Saúde de Qualidade | |
| datacite.subject.sdg | 09:Indústria, Inovação e Infraestruturas | |
| datacite.subject.sdg | 04:Educação de Qualidade | |
| dc.contributor.advisor | Tavares, Álvaro | |
| dc.contributor.author | Aguiar, Diogo Gonçalo Ribeiro Paulo e Soares | |
| dc.date.accessioned | 2026-05-19T13:12:25Z | |
| dc.date.available | 2026-05-19T13:12:25Z | |
| dc.date.issued | 2025-11-04 | |
| dc.description.abstract | O cancro é um dos maiores desafios da saúde global, resultando de alterações genéticas, epigenéticas e da desregulação de vias de sinalização. Esta tese centrou-se na via Hedgehog (HH), conservada evolutivamente e crucial no desenvolvimento embrionário, frequentemente desregulada em vários tipos de neoplasias. O objetivo principal foi analisar a expressão diferencial dos genes da via HH e associados em diversos cancros, com foco no carcinoma renal de células claras (KIRC) e no glioma de baixo grau (LGG), avaliando também o seu impacto prognóstico e potenciais mecanismos regulatórios. Utilizando abordagens bioinformáticas e bases de dados públicas (TCGA, GTEx, GEPIA2, cBioPortal, MethSurv, STRING, TIMER2.0, UCSC Xena Browser e UALCAN), foram analisados dados de expressão génica, metilação de DNA, mutações, infiltração imune e interações moleculares. Verificaram-se diferenças relevantes na expressão de CDON e LRP2 (KIRC) e de KIF7, BOC, CSNK1A1, CSNK1G3, PTCH1, GAS1, SMO e SUFU (LGG) entre tecidos tumorais e normais. A expressão elevada de LRP2 e CDON associou-se a melhor sobrevivência em KIRC, enquanto SUFU e PTCH1 mostraram efeito protetor em LGG. Por outro lado, SMO e GAS1 foram associados a pior prognóstico em LGG. Foi ainda observada hipermetilação dos promotores de CDON e LRP2 em KIRC, sugerindo regulação epigenética, enquanto em LGG a desregulação parece ocorrer por mecanismos não mutacionais. As redes de coexpressão revelaram interações com vias como Wnt e PI3K/AKT. Conclui-se que a via HH tem impacto distinto consoante o subtipo tumoral, e alguns genes, como LRP2 e CSNK1A1, podem constituir biomarcadores ou alvos terapêuticos promissores, reforçando a importância de análises multi-ómicas aplicadas à oncologia de precisão. | por |
| dc.description.abstract | Cancer remains a major global health challenge, driven by genetic and epigenetic alterations and signaling pathway dysregulation. This thesis focused on the Hedgehog (HH) pathway, an evolutionarily conserved signaling cascade crucial for embryonic development and frequently deregulated in various malignancies. The main aim was to assess the differential expression of HH pathway genes and related genes across multiple cancer types, with particular emphasis on clear cell renal cell carcinoma (KIRC) and low-grade glioma (LGG), while also evaluating their prognostic impact and potential regulatory mechanisms. Using integrated bioinformatics approaches and public databases (TCGA, GTEx, GEPIA2, cBioPortal, MethSurv, STRING, TIMER2.0, UCSC Xena Browser and UALCAN), we analyzed gene expression, DNA methylation, mutation profiles, immune infiltration, and molecular interactions. Significant expression differences were identified for CDON and LRP2 (KIRC), and for KIF7, BOC, CSNK1A1, CSNK1G3, PTCH1, GAS1, SMO and SUFU (LGG), when comparing tumor and normal tissues. High expression of LRP2 and CDON correlated with improved survival in KIRC, while SUFU and PTCH1 showed a protective effect in LGG. In contrast, SMO and GAS1 were associated with poor prognosis in LGG. Promoter hypermethylation of CDON and LRP2 in KIRC suggested epigenetic regulation, while in LGG, the low mutation frequency of HH genes indicated non-mutational deregulation. Co-expression network analysis highlighted interactions with other pathways such as Wnt and PI3K/AKT. In conclusion, the HH pathway exhibits cancer-type-specific roles, and genes such as LRP2 and CSNK1A1 emerge as potential biomarkers or therapeutic targets. These findings emphasize the value of multi-omic data integration and tumor subtype-specific analysis to support precision oncology strategies. | eng |
| dc.identifier.tid | 204081920 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.1/28997 | |
| dc.language.iso | por | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
| dc.subject | Via hedgehog | |
| dc.subject | Cancro | |
| dc.subject | Bioinformática | |
| dc.subject | Metilação do dna | |
| dc.subject | Prognóstico | |
| dc.subject | Expressão génica | |
| dc.title | Análise Bioinformática da Via Hedgehog em Cancros Humanos: Expressão, Metilação e Impacto Prognóstico no KIRC e LGG | |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| thesis.degree.grantor | Universidade do Algarve. Faculdade de Medicina e Ciências Biomédicas | |
| thesis.degree.level | Mestre | |
| thesis.degree.name | Mestrado em Oncobiologia – Mecanismos moleculares do cancro |