UA01-Teses
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- Mesozooplankton community dynamics in response to suppressed upwelling: a case study comparing the gulf of panama and the Gulf of Chiriquí using automated image analysisPublication . Becker, Lina; Mendes, Isabel Maria de Paiva Pinto; Schiebel, RalfThis thesis investigates mesozooplankton community dynamics in response to anomalous oceanographic conditions, focusing on the 2025 collapse of the seasonal upwelling in the Gulf of Panama. Using a comparative approach with the neighboring Gulf of Chiriquí, the study integrates semi-automated FlowCam imaging with supervised machine learning classifiers to process over 750,000 plankton images. This methodology enabled reliable abundance, and biomass estimates for dominant taxa, particularly copepods, at resolutions and scales unattainable through traditional microscopy. Hydrographic measurements revealed strongly stratified conditions in the Gulf of Panama, with suppressed nutrient input into the euphotic zone. In contrast, the Gulf of Chiriquí maintained relatively stable conditions. Ecological consequences were profound: the Gulf of Panama, typically characterized by high productivity due to upwelling, exhibited markedly reduced mesozooplankton abundance and biomass. Conversely, the Gulf of Chiriquí showed unexpectedly higher biomass across most depths, highlighting its role as a potential analogue for future oligotrophic states under climate-driven variability. Copepods remained the numerically and functionally dominant group, underscoring their resilience and central role in trophic transfer. However, size-structured analyses revealed that biomass patterns were not solely linked to abundance but strongly influenced by ontogenetic stage distribution. The disproportionate contribution of larger size fractions to carbon stocks emphasizes the importance of monitoring size structure in addition to abundance. Methodologically, the study demonstrates the value of hybrid workflows combining automated imaging with targeted manual curation. Despite challenges such as misclassification of transparent taxa and debris, semi-automated imaging proves scalable and essential for long-term ecological monitoring. Ultimately, the findings provide critical baseline data for understanding mesozooplankton dynamics under anomalous conditions. They highlight both resilience and vulnerability: while copepods persist, the productivity of short food chains may increasingly be at risk in a warming and more variable ocean.
- Histórias de sucesso universitário de diplomados com deficiência: uma análise ecológica de fatores pessoais e contextuaisPublication . Mestre, Cristina Soares; Borges, Maria LeonorEste trabalho de investigação teve como objetivo compreender os fatores que contribuíram para o sucesso académico de diplomados com deficiência no ensino superior, centrando-se nas suas experiências, percursos e perceções. Com base numa abordagem ecológica e numa metodologia qualitativa de cariz descritivo e interpretativo, procurou-se identificar a interação entre fatores pessoais e contextuais que permitiram aos participantes aceder, permanecer e concluir com êxito a formação universitária. O estudo integrou-se num projeto internacional coordenado pela Universidade de Sevilha e, em Portugal, pela Universidade do Algarve. Utilizou-se o método biográfico-narrativo, através da realização de entrevistas semiestruturadas a seis diplomados com diferentes tipos de deficiência, que partilharam os seus desafios, estratégias, apoios e conquistas no percurso académico. A análise das entrevistas foi orientada por uma grelha de categorias previamente validada, distinguindo fatores internos (como autodeterminação, resiliência, autoeficácia e autonomia) e fatores externos (como apoio familiar, relações interpessoais, serviços de apoio e políticas institucionais). Os testemunhos revelaram que o sucesso académico é um fenómeno complexo, que não se reduz ao desempenho académico, mas inclui também crescimento pessoal, sentido de pertença, superação de barreiras e construção de uma identidade positiva enquanto estudante universitário. A investigação evidenciou a importância de um ambiente universitário inclusivo, acessível e sensível à diversidade, bem como a necessidade de formação contínua da comunidade académica. Este estudo reforça a relevância de escutar as vozes dos próprios estudantes com deficiência, valorizando as suas experiências e promovendo a transformação das práticas educativas e institucionais no ensino superior.
- Investigating the role of frequency-dependent pre-conditioning to low oxygen and pH in building coral stress tolerancePublication . Littke, Sophie; Schoepf, Verena; Engelen, AschwinSevere hypoxia, often coupled with low pH, is an emerging threat to coral reefs, yet their combined effects, and the potential for environmental priming to modulate coral responses under such stress, remain understudied. In particular, the frequency and timing of prior sublethal exposure to combined low oxygen and pH are largely unexplored as drivers of coral stress tolerance. We conducted a controlled laboratory experiment to test how the frequency of nightly low dissolved oxygen (DO) and pH exposure shapes physiological responses of two Caribbean coral species, Agaricia tenuifolia and Siderastrea siderea, during subsequent, acute combined stress. Corals received six (high frequency, HF), three (low frequency, LF), or no (control) priming pulses, each lasting two consecutive nights, over four weeks, mimicking natural diel DO and pH cycles in shallow reefs, followed by 4–7 days of acute stress or ambient conditions. Results revealed contrasting species-specific outcomes. In A. tenuifolia, HF priming reduced baseline photosynthetic efficiency by 32% by the end of the priming period, with no further change during acute stress. HF primed A. tenuifolia also exhibited a ~42% reduction in symbiont densities, and a nearly tenfold increased risk of tissue loss compared to controls, regardless of acute stress treatment, while biomass and calcification remained unchanged. In contrast, S. siderea showed physiological stability across treatments, with LF priming supporting tissue biomass maintenance under acute stress. By the experimental end, biomass declined 28% and 22% in unprimed and HF-primed corals under acute stress, respectively, whereas LF primed corals maintained biomass. These findings highlight stress frequency as a critical yet understudied dimension of environmental priming and a direct modulator of baseline coral physiology. HF priming impaired the hypoxia-sensitive A. tenuifolia, while LF priming was neutral. The more hypoxia-tolerant S. siderea showed subtle LF priming benefits and no HF effects. As climate change and coastal eutrophication intensify diel variability and acute low DO and pH events, understanding frequency-dependent stress responses will improve predictions of reef community trajectories and help identify resilient coral populations.
- Medicamentos contendo valproato e medidas adicionais de minimização de risco – conhecimentos e atitudes do farmacêutico comunitárioPublication . Pereira, João Diogo Santos; Ramalhinho, IsabelA farmacovigilância constitui um pilar essencial da segurança do medicamento, sendo as medidas adicionais de minimização de risco (MMRa) fundamentais quando as de rotina se revelam insuficientes. Os medicamentos contendo valproato, devido à sua teratogenicidade, estão sujeitos a várias MMRa como o Programa de Prevenção da Gravidez. O farmacêutico comunitário, enquanto último profissional de saúde em contacto com o utente antes do início da terapêutica, desempenha um papel fundamental na sua efetividade. Este estudo teve como objetivo avaliar os conhecimentos e atitudes dos farmacêuticos comunitários relativamente às MMRa dos medicamentos contendo valproato. Foi conduzido um estudo observacional, transversal, com recurso a um questionário online dirigido a farmacêuticos de farmácias filiadas da Associação Nacional das Farmácias (ANF). A amostra final incluiu 196 farmacêuticos das diferentes regiões do país. Os resultados mostram que 90,8% conhecem as MMRa, sendo a rotulagem/embalagem especial (75,5%) e as Comunicações dirigidas aos Profissionais de Saúde (65,8%) as mais conhecidas. Contudo, apenas 38,3% conhece o Programa de Prevenção da Gravidez e 29,2% as medidas destinadas a homens em idade fértil. Ainda existem 11,7% de farmacêuticos que não utilizam qualquer medida no ato de dispensa, alegando principalmente desconhecimento e dificuldade de acesso. Relativamente às atitudes na dispensa, 80,6% aconselha sobre contraceção eficaz e 77,6% referenciam para consulta médica em caso de suspeita de gravidez, embora 9,2% não presta qualquer aconselhamento. Os farmacêuticos comunitários revelam elevado conhecimento global, mas persistem lacunas em medidas específicas e recentes. O reforço formativo e a integração de alertas nos sistemas informáticos poderão aumentar a adesão às MMRa e garantir o uso seguro dos medicamentos.
- Uncovering metabolic vulnerabilities and validation of anti-cancer targetsPublication . Yassuda, Victor; Méndez-Lucas, Andrés; Novellasdemunt, Laura; Coelho, Ana Luísa de SousaCancer is a second leading cause of disease-related death worldwide, with one of its defining hallmarks being the tumor metabolism reprograming to sustain growth and survival. While glucose and glutamine have long been recognized as central nutrients, lipid metabolism has recently emerged as a critical element of this metabolic rewiring. Lipids not only provide a dense source of energy but also supply essential building blocks for membrane biosynthesis, thereby supporting proliferation and adaptation. These roles make lipid metabolism an attractive direction for identifying therapeutic vulnerabilities. Based on previous results from our group, we hypothesize that genetic-enzymatic compensations are responsible for reducing the impact of silencing genes associated with lipid metabolism reestablishing the flux. Therefore, our goal was to develop a strategy to double silence oncogene-induced tumor models in vivo via hydrodynamic transfection. As a complementary strategy, we start the develop of colon cancer organoids through sequential CRISPR editing of APC, TP53, KRAS, and SMAD4.So that the same metabolic targets could be extrapolated to other tissues. In parallel, we refined isotopetracing gas chromatography mass spectrometry (GC-MS) protocols to enable highresolution profiling of both polar and apolar metabolites in cellular and organoid system Pilot studies confirmed the feasibility of dual-shRNA constructs and demonstrated reliable induction of MYC expression in vitro, although in vivo tumor formation remains to be optimized. Colon organoids with triple and quadruple edits showed differential tumorigenicity, consistent with literature, while highlighting the need for refined implantation strategies. Importantly, we established robust isotope-tracing GC-MS protocols capable of detecting elongation products beyond C:20 fatty acids and profiling organoid metabolism. Together, these results provide methodological validation and a solid foundation for future studies aimed at uncovering compensatory mechanisms and metabolic vulnerabilities in cancer.
- Estratégias Metacognitivas e Motivação na Aprendizagem das Competências receptivas em inglêsPublication . Salomão, Marcus Vinícius Gonçalves; Almeida, António Carlos Pestana Fragoso deNeste trabalho, procuramos discutir conceitos relacionados com a motivação e a metacognição no contexto da aprendizagem de inglês como segunda língua (L2) por estudantes adultos. Quanto ao construto motivação, consideramos os quadros conceituais propostos por Bandura (1997) com a teoria da autoeficácia, Ryan e Deci (2000) com a teoria da autodeterminação, e Gardner (1985) com seu modelo motivacional. Relativamente à metacognição, baseamo-nos nos trabalhos de autores como Flavell (1979), Chamot (1998) e Zimmerman (2002), que destacam a autorregulação da aprendizagem. Além disso, exploramos a associação entre metacognição e o desenvolvimento de competências linguísticas receptivas, como a compreensão auditiva e a leitura, conforme abordado por Surkamp e Yearwood (2018), Lennon (2020) e Goh e Vandergrift (2021). Por último, discutimos e avaliamos o impacto da integração dessas estratégias no engajamento e autonomia dos estudantes. No total, foram inquiridos 15 estudantes adultos do Instituto Wall Street English de Faro, em Portugal. Para a avaliação das variáveis em estudo, utilizaram-se entrevistas semiestruturadas, com o objetivo de captar a percepção dos estudantes sobre sua relação com o inglês e sobre a experiência de construção do conhecimento por meio de técnicas metacognitivas de aprendizagem, complementadas por observações sistemáticas das sessões dessas atividades. Os resultados obtidos permitiram identificar as diversas motivações dos estudantes (intrínsecas e extrínsecas) e o impacto positivo das técnicas metacognitivas na sua autonomia, confiança e compreensão do processo de aprendizagem. Estes resultados, em conjunto com as percepções sobre a dinâmica da sala de aula, permitiram-nos encontrar relações entre os construtos, que se assumem como complexas e multifacetadas, no que diz respeito à motivação e aos fatores que parecem determinar a forma como os estudantes abordam o processo de aprendizagem do inglês como L2.
- Green extraction technique using natural deep eutectic Solvents (NADES) and supramolecular solvents (SUPRAS) to recover bioactive compounds from medicinal halophyte Polygonum Maritimum L.Publication . Udoji, Mmaduabuchi Desmond; Custódio, Luisa; Lopes, André D.A extração sustentável de compostos bioativos de alto valor a partir de recursos naturais continua sendo um desafio crítico na química verde. Este estudo avalia a eficácia dos Solventes Eutéticos Profundos Naturais (NADES) e dos Solventes Supramoleculares (SUPRAS) como alternativas inovadoras e sustentáveis aos solventes convencionais para a extração de compostos fenólicos e alcaloides de Polygonum maritimum, uma planta com potencial bioativo pouco explorado. Quatro sistemas NADES e dois SUPRAS, incluindo suas formas em equilíbrio e híbridas, foram avaliados utilizando extração assistida por ultrassom (UAE) e comparados com etanol e água como solventes de referência. Entre os solventes testados, a mistura Cloreto de colina: ácido lático (CC:LA) apresentou a maior atividade antioxidante no ensaio DPPH, com um valor de IC₅₀ de 0,0281 ± 0,014 mg/mL, superando significativamente o Cloreto de colina: ácido málico (CC:MA). Esses resultados foram corroborados pelas medições do teor total de flavonoides (TFC) e pela análise por LC-MS, confirmando a presença de diversos compostos fenólicos. Embora o etanol tenha extraído a maior quantidade total de bioativos, os NADES e SUPRAS demonstraram enriquecimento seletivo e recuperação de compostos fenólicos específicos e alcaloides. Este estudo ressalta a integração promissora dos NADES e SUPRAS com UAE como uma abordagem ecoeficiente e escalável para a extração de produtos naturais valiosos de plantas marinhas.
- Whistle structure and geographical variations in three delphinid species recorded in eastern Algarve CoastPublication . Gil, Susana; Jesus, Sérgio Manuel Machado; Soares, CristianoThis study aims to characterize and compare the whistle repertoires of three odontocete species, Delphinus delphis (short-beaked common dolphin), Tursiops truncatus (common bottlenose dolphin), and Pseudorca crassidens (false killer whale), in the coast of Faro. This knowledge is essential for their monitoring and conservation, particularly for this region. Especially because this is an area with high anthropogenic pressure and limited prior research. These species were chosen due to their presence in the region and high vocal activity, with special emphasis on the poorly studied false killer whale (Pseudorca crassidens), recently observed using the area as a seasonal feeding ground. Recordings were obtained between April 2022 and June 2024 using an opportunistic platform during dolphin and whale watching surveys. A total of 36 acoustic events were analyzed. Visual analysis and manual whistle extraction of ten acoustic parameters were conducted using Raven Pro: beginning, end, minimum, and maximum frequency, frequency range, duration, initial and final slope, number of inflection points, and number of steps. In total 327 whistles were analyzed and used in this study. Whistle contours were also categorized into six standard types according to previous studies (Constant, Upsweep, Downsweep, Convex, Concave and Sine). Statistical analyses were conducted to describe and categorize the repertoire of the three species. A non-parametric Kruskal-Wallis’ test was used to determine overall differences in whistles parameters among species, pairwise with Dunn’s test and adjusted with sequential Bonferroni. A non-metric multidimensional scaling (NMDS) was used to visualize acoustic separation between species. The whistles contours were also compared using a correlation matrix. Additionally, a Random Forest model measured the classification performance and the importance of each acoustic variable. Results showed significant acoustic differences in whistle parameters between species, especially between Pseudorca crassidens and the two other dolphin species. Delphinus delphis and Tursiops truncatus showed higher variability in frequency and contour type, potentially related to behavioral context or social structure. To explore potential geographic variation, Faro data was compared with published values from other geographic regions to evaluate possible geographic divergence using mean values of frequency parameters available in literature. Geographic comparisons revealed that the population of Faro exhibits distinct whistle characteristics when compared to populations from other regions. The results also showed that geographic distance alone does not predict acoustic similarity or divergence. Instead, environmental context plays a key role in shaping dolphin’s repertoire, likely driving specific acoustic adaptations. These findings contribute to baseline knowledge of local cetacean acoustic repertoires and highlight the importance of passive acoustic monitoring for population, behavioral, and conservation studies. This work reinforces the importance of regional characterization to detect alterations related to human activity and environmental change, and it supports future efforts to implement effective mitigation and management strategies for cetacean conservation in southern Portugal.
- Autopercepção e experiências de vida no uso de substâncias: uma revisão sistemática da literatura sobre a interação entre autoeficácia e estilos parentaisPublication . Pereira, Victor André Paiotti; Nunes, CristinaA autoeficácia e estilos parentais são fatores cruciais no desenvolvimento e influência do comportamento de jovens, porém sua relação com o consumo de substâncias necessita de mais pesquisas e aprofundamento. Nesta revisão sistemática da literatura pretendeu-se analisar e sintetizar como os estilos parentais e autoeficácia se relacionam com o consumo de substâncias em adolescentes e jovens adultos. Através das diretrizes do PRISMA, foi realizada uma busca sistemática em bases de dados relevantes, no qual resultou na inclusão de 20 estudos quantitativos e qualitativos, e sua qualidade foi avaliada através da ferramenta MAAT. Os estilos parentais Autoritativo e Indulgente foram constantemente associados a menores índices de consumo, enquanto os estilos Autoritário e Negligente demonstram ser fatores de risco. Já a autoeficácia demonstrou ser um fator de proteção robusto e um mediador crucial da influência parental. Assim, a prevenção e tratamento do consumo de substâncias requer uma abordagem integrada que vise fortalecer relações familiares positivas e a autoeficácia.
- A relação entre o mind wandering e as funções executivasPublication . Domingos, Lucas Teodoro; Inácio, Filomena CaféO Mind Wandering (MW) carateriza-se como uma alteração do foco da atenção de uma tarefa para conteúdo mental autogerado, cuja frequência e manutenção pode ser influenciada pelas funções executivas. O objetivo deste estudo foi investigar através de instrumentos de autorrelato a associação entre a frequência de episódios de Mind Wandering e dificuldades da vida diária devido a défices de funções executivas, mais especificamente a relação entre o MW espontâneo e deliberado e os défices de funções executivas. Observou-se que a frequência do MW espontâneo está moderadamente correlacionada com os défices de funções executivas, enquanto o MW deliberado apresenta uma correlação negligível com os mesmos. Este estudo salienta a viabilidade da utilização de instrumentos de autorrelato para o estudo do MW e das funções executivas, numa área de estudo onde predomina o contexto experimental.