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- Variação do nível do mar na costa algarvia durante o PlistocénicoPublication . Albardeiro, L.; Moura, Delminda; Veiga-Pires, C.; Boski, T.São objectivos do presente trabalho, o estudo da evolução da morfologia costeira durante o Plistocénico Superior, a correlação de plataformas de abrasão marinha com a estratigrafia isotópica marinha e a utilização da informação recolhida como uma ferramenta de gestão costeira.
- Quality and distribution of assimilates within the whole plant of lupines (L. albus And L. mutabilis) influenced by water stressPublication . Carvalho, Isabel Saraiva de; Ricardo, C. P.; Chaves, Maria ManuelaLupine crops (Lupinus albus and L. mutabilis) often experience water deficits during grain filling, thereby altering partitioning of assimilates. Water deficit, imposed at the beginning of seed production (15 days after anthesis, daa), brought about differences in assimilate partitioning and chemical composition within the whole plant. In both species, water stress (ws) was responsible for a significant decrease in plant water status and gas exchange. In spite of little effect on total biomass, leaf area was reduced for approximately half of the control treatment. The main effects of ws on chemical composition of different organs were a decrease in total oil and an increase in total soluble sugar content in leaves; an increase in both oil and soluble sugars in stems; and a decrease in total oil and total soluble sugar content in seeds. The data suggest that under ws conditions, imposed at flowering, lupine assimilates are stored in stems and pods and later retranslocated to the developing seeds.
- Produção de elicitinas recombinantes de Phytophthora cinnamomiPublication . Sousa, Nelson Guerreiro Mendes de; Cravador, Alfredo Jaime Morais eA doença do declínio do sobreiro é um fenómeno complexo que provoca uma diminuição visível do vigor vegetativo da árvore. O fungo Phytophthora cirmamomi está associado a esta doença radicular, provocando a morte maciça das raízes finas, reduzindo acentuadamente a capacidade das árvores para absorver água e substâncias nutritivas do solo, conduzindo ao enfraquecimento gradual das extremidades dos ramos e à queda das folhas. As elieitinas são um grupo de holoproteínas altamente conservadas segregadas por espécies do género Phytophthora (com a excepcção da Phytophthora parasitica var. nicotianae) e por Pythium vexans. Estes polipeptídeos de baixa massa molecular ( ~ 10,3 kDa), constituídas por 98 aminoácidos, induzem uma resposta de hipersensibilidade e resistência sistémica adquirida em espécies de plantas sensíveis. A função das elieitinas na biologia das espécies Phytophthora ainda não é clara, não se sabendo se estas proteínas contribuem directamente para a patogenicidade das espécies Phytophthora. O presente trabalho foi dividido em três partes. Na primeira parte, extraiu-se o RNA total de micélio de P. cirmamomi, a partir do qual se sintetizaram e amplificaram, por PCR, os ORF°s (“Operi Reading Frame ”) dos quatro genes do cluster recorrendo a primers específicos. Os produtos da amplificação foram sujeitos a uma análise de restrição enzimática. Na segimda parte, fez-se um estudo da expressão de elieitinas de diferentes isolamentos de duas espécies de Phytophthora. A análise deste estudo mostrou que o isolamento Pa20 de P. cirmamomi expressa uma maior quantidade de elieitinas e num intervalo de tempo menor, em comparação com os isolamentos estudados de P. cambivora. Na terceira parte, produziu-se B-cinamomina e ot-cinamomina heterólogas. Com o recurso a células de Pichia pastoris, previamente transformadas com o ORF do gene da B-cinamomina induziu-se a expressão da respectiva proteína. Os sobrenadantes contendo a B-cinamomina passaram por mn processo de purificação que incluiu: concentração, diálise, cromatografia de troca iónica e Fast Protein Liquid Chromatngmphy (FPLC). A análise da B-cinamomina foi feita através de SDS-PAGE e immunobloting.
- Optimal space-time coverage and exploration costs in groundwater monitoring networksPublication . Nunes, LM; Cunha, MC; Ribeiro, LA method to determine the optimal subset of stations from a reference level groundwater monitoring network is proposed. The method considers the redundancy of data from historical time series, the times associated with the total distance required to run through the entire monitoring network, and the sum of the times for each monitoring station. The method was applied to a hypothetical case-study consisting of a monitoring network with 32 stations. Cost-benefit analysis was performed to determine the number of stations to include in the new design versus loss of information. This optimisation problem was solved with simulated annealing. Results showed that the relative reduction in exploration costs more than compensates for the relative loss in data representativeness.
- Estudo da biogeoquímica dos sedimentos estuarinos através da cor: Resultados preliminaresPublication . Mestre, Nélia; Veiga-Pires, C.As zonas costeiras desempenham um papel importante no desenvolvimento das regiões e ao longo dos séculos foram locais privilegiados para a ocupação humana. O estudo de sedimentos estuarinos aplicado à evolução do nível do mar ao longo dos tempos é de extrema importância, pois reflecte avanços e recuos da linha de costa originados por variações climáticas, quer a nível mundial, quer a nível regional e local.
- Adding value to performance measurement by using system dynamics and multicriteria analysisPublication . Santos, Sérgio Pereira dosMeasuring performance either formally or informally is a common practice in most organisations. It is well established that performance measurement plays a critical role in organisations, signalling how well they are succeeding in achieving their objectives and identifying where improvement efforts are required. In an attempt to respond to the assessment needs of organisations, several performance measurement frameworks have been developed over the years. However, in spite of the remarkable progress that has been made in the development of better integrated, balanced and strategically driven performance measurement frameworks, there are issues which deserve further research if these frameworks are to provide a stronger basis from which to manage effectively for improvement. Informed by the literature review and conceptual experimentation, this thesis aims to show that the use of system dynamics (SD) and multiple criteria decision analysis (MCDA), individually and in an integrated manner, can address some of these issues and bring new insights to inform and support the different stages of the performance measurement and management process. To this purpose, a framework incorporating the integrated use of SD and MCDA is suggested and its conceptual coherence and practical relevance is discussed. The conceptual coherence is illustrated by a simple but realistic application in the health care sector. The practical relevance of the framework is assessed in an organisational setting, taking the form of three in-depth case studies. Several conclusions are drawn regarding the potential role of SD and MCDA to add value to the performance measurement and management process, including an assessment of their suitability, limitations, and implementation issues associated with this particular context.
- Consequências da alteração climática do Holocénico Médio nas zonas costeiras: Algarve, PortugalPublication . Moura, Delminda; Albardeiro, L.; Boski, T.; Veiga-Pires, C.; Rodrigues, A. L.Na costa Sul do Algarve, estão expostos aeolianitos correspondentes a duas fases morfogenéticas do Holocénico Médio, correlativas em parte, da alteração climática generalizada que ocorreu no hemisfério norte, cerca dos 8000 anos.
- Introdução à evolução holocénica dos estuários do AlgarvePublication . Boski, T.; Moura, Delminda; Wilamowski, A.; Veiga-Pires, C.Os estudos desenvolvidos durante os últimos 5 anos abrangeram os 3 estuários da região: Guadiana, Gilão- Almargem e Arade.
- O herói infantil: o processo de crescimento nos contos tradicionais portuguesesPublication . Raposo, Sandra Maria Correia Gonçalves; Reis, Isabel Cristina David Cardigos dosNeste estudo, intitulado O Herói Irƒantil: O Processo de Crescimento nos Contos Tradicionais Portugueses, tenho como objectivo analisar os contos tradicionais de cariz maravilhoso, com herói infantil, centrando-me na criança enquanto protagonista e destinatária privilegiada. No primeiro capítulo, abordando a generalidade dos contos da tradição oral, exploro a dimensão do universo infantil neles presente, considerando O que eles podem oferecer à criança e ao adulto. No segundo capítulo explicito a possibilidade de interpretação dos contos enquanto mensagens alegorizadas. Aqui demonstro como considero ser viável a aplicação do conceito de alegoria a produções desta natureza, apesar de se tratar de um conceito frequentemente associado a elaborações eruditas. No terceiro capítulo abordo aspectos relacionados com a problemática dos emissores, público alvo, contextos, funcionalidade e objectivos inerentes aos contos tradicionais maravilhosos. No último ponto deste capítulo, contrariando a ideia generalizada segundo a qual todas essas narrativas se destinam às crianças, procedo à identificação dos elementos que contribuem para a caracterização de um determinado grupo de contos como narrativas especificas para crianças, ao qual pertencem aquelas que analiso. No quarto e último capitulo, após identificar O material de estudo, procedo à sua distribuição por dois grupos, consoante o perfil dos heróis que protagonizam os contos seleccionados. Apoiando-me nos pressupostos teóricos referenciados nos capítulos anteriores e efectuando um exercício de leitura comparada das versões de cada conto, procuro encontrar, a partir do comportamento das personagens e da interacção que estas estabelecem entre si, sentidos que conduzam a interpretações sobre os diferentes aspectos do crescimento da criança.
- Estudo da biodiversidade molecular de Quercus suber e caracterização de genes envolvidos na resposta de defesa à infecção por Phytophthora cinnamomiPublication . Coelho, Ana Cristina; Cravador, A.O sobreiro (Quercus suber L.) é uma espécie autóctone que se encontra distribuída em todo o território de Portugal Continental. São excepção as regiões montanhosas mais frias do norte e centro, as regiões salinas junto ao litoral e as zonas do interior de acentuada aridez. Os indivíduos desta espécie apresentam características morfológicas muito variadas com ocorrência de diversas gradações entre caracteres do mesmo órgão e diferentes graus de tolerância, aparente, à doença do declínio. A semelhança genómica descrita dentro do género Quercus determina a ausência de barreiras reprodutivas e possibilita fenómenos de hibridação nos povoamentos mistos de Q. suber e Q. rotundifolia. O recurso à análise do DNA para determinação do perfil genético dos indivíduos de uma espécie, consiste no método mais recente de individualização biológica. No presente estudo, foi avaliada a variabilidade genética em Q. suber por AFLP (amplified fragment length polymorphism), com cinco combinações de primers diferentes, que permitiram diferenciar 313 árvores provenientes do Algarve, Alentejo e Trás-os-Montes, de acordo com o seu genótipo. O perfil genético de cada sobreiro resultou da análise de 291 loci aleatórios do genoma, presentes na forma de fragmentos monomórficos e polimórficos. A avaliação quantitativa das semelhanças ou dissemelhanças entre os indivíduos foi determinada pelo método de análise de dados/taxonomia numérica. A percentagem de polimorfismo detectada nos sobreiros é de 71 % e é indicadora de índices elevados de variabilidade na espécie. A diversidade genética é semelhante nas populações estudadas do Algarve, Alentejo e Trás-os-Montes. A elevada variação fenotípica que se observa em Q. suber ao nível da qualidade da cortiça produzida e da aparente tolerância à doença do declínio é reflectida nos padrões AFLP. Os valores dos coeficientes de semelhança genética variam entre 0,88 e 0,61, o que significa que, apesar da elevada diversidade genética, os sobreiros partilham entre si 60 % do genoma. No grupo dos 313 indivíduos de Q. suber observa-se uma tendência para a separação em dois subgrupos. Na análise por AFLP com uma das combinações de primers, a combinação I9, foram incluídas 52 azinheiras provenientes das mesmas três regiões, Algarve, Alentejo e Trás-os-Montes, dos sobreiros. Duas destas azinheiras foram estudadas, também, com as outras quatro combinações de primers referidas para os sobreiros. Em todas as combinações de primers houve diferenciação entre os 313 indivíduos da espécie Q. suber e os dois indivíduos da espécie Q. rotundifolia, em concordância com a classificação sistemática destes Quercus. Na análise em que se incluíram as 52 azinheiras e os 313 sobreiros, identificaram-se indivíduos pertencentes a uma terceira espécie. Através da determinação de perfis genéticos de indivíduos de espécies diferentes do género Quercus é possível determinar as relações filogenéticas existentes entre eles. Um dos 291 marcadores AFLP está presente em quase todas as azinheiras e em onze sobreiros e este facto revela que pode ter sido adquirido por hibridação entre as duas espécies de Quercus. A metodologia usada permitiu identificar marcadores moleculares potencialmente correlacionados com fenótipos de tolerância à doença do declínio e à qualidade da cortiça. Alguns marcadores só estão presentes em sobreiros de determinada região e podem ser o resultado dum processo de adaptação ao meio. Em Portugal e Espanha a doença do declínio afecta, de um modo geral, os povoamentos de sobreiro e azinheira, atinge indivíduos de todas as idades e manifestase na forma de declínio lento ou morte súbita. O fungo do solo, Phytophthora cinnamomi, aparece invariavelmente associado aos locais de declínio e tem sido isolado, com frequência, a partir de raízes de sobreiros e azinheiras. Q. suber e Q. rotundifolia são, portanto, hospedeiros de P. cinnamomi e o fungo é capaz de colonizar os tecidos, sendo desconhecidos os mecanismos moleculares da interacção entre o hospedeiro e o agente patogénico. Através da análise do RNA mensageiro, por cDNA-AFLP, de raízes de Q. suber e Q. rotundifolia infectadas com P. cinnamomi, de folhas de plântulas de sobreiros cultivados em solos artificialmente infestados e de folhas de sobreiros localizados em locais de declínio, naturalmente infestados com o fungo, foram identificados fragmentos de genes que se expressam de forma diferencial durante a interacção. As sequências de quatro destes fragmentos apresentam homologia com genes relacionados com o sistema de defesa noutras espécies de plantas. As sequências nucleotídicas foram determinadas a partir dos cDNAs correspondentes obtidos por RACE-PCR ou, alternativamente, a partir dos genes isolados num banco genómico de Q. suber em Lambda FIX II escrutinado com sondas específicas. Foram identificados e caracterizados em Q. suber, os genes QsCAD1, QsRPc, QsPDI e QsRSH que codificam uma cinamil álcool desidrogenase 1, uma proteína de resistência a P. cinnamomi, uma isomerase de pontes dissulfureto proteica e uma proteína do tipo RelA/SpoT, respectivamente. Pelo menos três destes genes estão potencialmente envolvidos na resposta à infecção por P. cinnamomi; com efeito a expressão de QsCAD1, QsRPc e QsPDI aumenta durante as primeiras 24 horas de interacção. É conhecido que o sistema de defesa nas plantas é multifacetado e que a transcrição dos genes do metabolismo de fenilpropanóides é activada durante a interacção com agentes patogénicos. A partir de fragmentos obtidos por PCR com primers de sequência heterogénea definidos a partir de sequências conhecidas de genes do metabolismo de fenilpropanóides doutras espécies de plantas, foram determinadas sequências nucleotídicas parciais codificando uma peroxidase (QsPOX), uma cinamil álcool desidrogenase 2 (QsCAD2) e uma fenilalanina amónia liase (QsPAL) em Q. suber. Com base nesta informação foram clonados, sequenciados e caracterizados, parcial ou completamente, o cDNA e/ou DNA dos genes QsPOX (1 e 2), QsCAD2 e QsPAL que codificam duas peroxidases catiónicas, uma cinamil álcool desidrogenase e uma fenilalanina amónia liase, respectivamente. A expressão destes genes foi analisada por RT-PCR e hibridação com sondas específicas marcadas com digoxigenina, a partir de RNA total extraído de raízes de Q. suber que estiveram em contacto com o fungo durante 24 horas, verificando-se que QsPOX2 e provavelmente, QsPOX1, estão envolvidas na resposta de defesa. Relativamente aos genes QsCAD2 e QsPAL os resultados não foram conclusivos. Tendo em consideração a homologia entre as sequências de aminoácidos deduzidas dos genes identificados em Q. suber com a de proteínas já caracterizadas noutras espécies, foi possível conceber um modelo hipotético que ilustra os acontecimentos iniciais da interacção entre o fungo e o hospedeiro. Deste modo, considera-se que a infecção de Q. suber por P. cinnamomi apresenta contornos de interacção compatível e incompatível. O fungo induz a expressão de genes potencialmente implicados na desactivação de factores de virulência (toxinas) e de genes de defesa implicados no reconhecimento de factores de avirulência. A variante da doença do declínio denominada “morte súbita” estaria associada à produção duma isoforma do produto do gene QsCAD1, incapaz de converter o factor de virulência (toxina) produzido pelo fungo, num produto não tóxico para a célula. Num sobreiro que sofreu morte súbita foi identificado um fragmento polimórfico deste gene que apoia esta hipótese. O declínio lento resultaria da resistência parcial ao fungo, relacionada com a rapidez de reconhecimento dos factores de avirulência.