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- Identification of novel key factors of heart development using a systems biology approachPublication . Machado, Rui Sotero Rodrigues; Futschik, Matthias E.; Bragança, JoséHeart diseases are the leading cause of death worldwide. Although surgical interventions can provide valuable options for treatment, current therapies in cardiovascular medicine only delay disease progression. A main reason for this shortcoming is the limited regenerative capacity of the adult human heart. In contrast to many other tissues and organs, the mammalian heart has very limited regenerative capacity. However, it has been observed that neonatal hearts in mice show remarkable capacity to regenerate lost functional muscle tissue, a capacity that rapidly disappears after the first post-natal week. Therefore, the study of heart development might give crucial cues for cardiac regenerative medicine. Heart development or cardiogenesis is a highly complex process with many components that are finely tuned in a precise manner across time and space. Regulation of gene expression plays an important role in this process. To capture this level of regulation, technologies such as microarrays or next generation sequencing provide powerful tools, as they enable the simultaneous measurement of expression levels of thousands of coding and non-coding genes. Although, it is possible to obtain the expression information of several thousand of genes, there is a clear lack of platforms in which research can scan through this information to develop or generate insightful biological questions in the field of heart study. Hence, this doctoral research work has tried to provide different systems biology approaches in order to offer new insights into gene expression events that occur mainly during heart development. These approaches include: (i) the integration of more than 20 published microarray studies related to cardiogenesis and the development of the HeartEXpress database (http://heartexpress.sysbiolab.eu/) to provide an easy and public access to the integrated data; (ii) the integrative analysis of a genome-wide study profiling coding and noncoding genes during embryonic heart development in vivo; (iii) the assessment of transcription factors and miRNAs previously associated to heart development; (iv) the integration and prioritisation of miRNA-mRNA interactions to identify novel miRNAs, mRNAs or miRNAinteractions with potential impact on cardiogenesis; (v) the development of a web-server called HeartmiR (http://heartmir.sysbiolab.eu/), which enables independent query and visualisation of miRNA-mRNA interactions obtained from the in vivo study; and (vi) comparative analysis of in vivo and in vitro studies to obtain further insights into mRNA, miRNA and miRNA-mRNA interactions during embryonic stem cell differentiation and to clarify how the in vitro experiment can be used as a faithful model to study embryonic heart formation. The main contributions of this research work for the study in the heart field are: 1. The development of HeartEXpress, which is a database that integrates the expression of more than 16400 genes and 130 experimental conditions in both human and mouse; 2. The development of HeartmiR, which is a database profiling the expression of 9211 mRNA and 386 microRNAs during the heart development period (from E10.5 to E19.5) and additionally in adult and old murine heart tissue; 3. Identification of the potential of 165 miRNAs to be involved in heart development using different methods of miRNA candidate prioritisation; 4. Identification of 102 miRNA and 214 putative novel miRNA-mRNA interactions relevant for cardiac cell development in vivo and in vitro. Furthermore, from the top20 miRNA with most interactions, 12 of the miRNA (60%) had been already associated to heart related events, indicating promising results for the remaining 8 miRNAs (40%) In summary, I have developed, implemented and applied different systems biology approaches to analyse both publicly available and new generated experimental data. As result, I was able to identify potential novel coding and non-coding key factors important for cardiogenesis that might be utilised as markers or targets in future cardiac regenerative medicine strategies.
- Descoberta automática de práticas de trabalho com técnicas de mineração de processosPublication . Gonçalves, João José Jóia; Zacarias, MarielbaA passagem para um mundo cada vez mais digital tem vindo a concretizar-se com o avanço da tecnologia a ocorrer de forma exponencial. Com ela tem crescido a necessidade de se analisar a imensidão de dados que empresas e organizações produzem a fim de identificar padrões, melhorias operacionais e tendências. A literatura tem-se dedicado ao estudo de processos de negócio e o Process Mining tem vindo a ganhar notoriedade como uma disciplina imprescindível ao crescimento de uma organização no que respeita à forma como analisa os seus dados, que passam a ser o Storyteller das mesmas. A mineração de processos dá respostas a questões que não ficam resolvidas pelas formas tradicionais de análise de dados, permitindo extrair conhecimento através de registos de eventos e assim descobrir novos modelos de processos, controlar e melhorar os processos já existentes. O estudo de caso sobre o qual este trabalho é desenvolvido debruça-se sobre o contexto organizacional real, na identificação de práticas de trabalho a partir de registo de ações relacionadas ao desenvolvimento de aplicações de web para um banco comercial. Como objetivo de estudo, procurou-se realizar uma análise comparativa de vários algoritmos de Process Mining disponíveis na ferramenta ProM. A análise realizada teve por base encontrar o algoritmo mais apropriado às especificações dos dados do caso de estudo, através de medidas de qualidade presentes na verificação de conformidade. Numa primeira fase, os dados foram extraídos, mapeados e importados para a ferramenta ProM e seguidamente aplicaram-se algoritmos de descoberta de processo. O resultado final gerou modelos de processo em rede Petri Net que foram analisados através da verificação de conformidade. Por fim, foi possível verificar através dessas análises que dos algoritmos testados, o que obteve melhor resultado foi o Heuristic Miner.
- Establishment of microalgae as functional food with antioxidant and anti-inflammatory propertiesPublication . Silva, Mélanie Vanessa Martins; Barreira, Luísa; Esteves, E.; Arco, JoaquimAs doenças crónicas não-transmissíveis (DCNT), tais como doenças cardiovasculares, cancros, doenças respiratórias e diabetes, são a principal causa de mortalidade e morbilidade a nível mundial, sendo consideradas um dos maiores problemas de saúde pública da atualidade pela Organização Mundial de Saúde. Para além das DCNT estarem relacionadas com o aparecimento de diversas comorbilidades, suspeita-se que ampliem os impactos da pandemia por COVID-19, diminuindo a qualidade de vida dos infetados. A maior parte dos fatores de risco para desenvolvimento de DCNT são preveníeis e modificáveis através de mudanças de estilo de vida, como a prática de atividade física e a adoção de uma alimentação saudável. Recentemente tem-se verificado uma maior consciencialização dos consumidores relativamente ao papel da alimentação na modulação da saúde, levando à alteração nos padrões de consumo. Atualmente, os consumidores preocupados com a saúde reconhecem a alimentação saudável como um pilar da prevenção de doenças crónicas e procuram alimentos que para além do seu valor nutricional apresentem também benefícios para a sua saúde. Quando inseridos num estilo de vida saudável, os alimentos funcionais para além de fornecer macronutrientes necessários à sobrevivência, influenciam funções específicas do organismo através dos seus compostos ativos atuando a nível da promoção da saúde e/ou prevenção da doença. Para além das fontes tradicionais de compostos ativos (frutas, vegetais, cereais integrais, entre outros), a necessidade de satisfazer as expetativas dos consumidores tem estimulado a indústria alimentar a investigar fontes alternativas de alimentos funcionais. As microalgas apresentam um elevado potencial como alimentos funcionais devido ao seu perfil nutricional de boa qualidade (elevado teor de proteínas, minerais, vitaminas, ácido gordos polinsaturados, entre outros) e abundância de compostos como atividades biológicas benéficas para o seu humano (atividade antibacteriana, antioxidante anti tumoral, antifúngica, antivírica, anti inflamatória, entre outros). Para além de taxa de crescimento elevada e baixo custo de produção, as algas podem ser induzidas a produzir compostos bioativos de valor acrescido específicos, por manipulação das condições de cultivo. Compostos com atividade antioxidante e anti-inflamatória são de particular interesse, uma vez que o dano oxidativo prolongado e inflamação crónica estão na base da maior parte das patologias.
- The effect of two inert diets on purple sea urchin, Paracentrotus lividus (Lamarck, 1816) growth and gonadal development, in aquaculturePublication . Loureiro, Paulo Filipe Machado; Engrola, Sofia Alexandra Dias; Pousão-Ferreira, Pedro MarquesThe purple sea urchin, Paracentrotus lividus, like other species of sea urchin, is of great economic interest, as its gonads are considered a delicacy. In certain countries, such as Japan, the sea urchin gonads, also known as “uni”, are fully part of the local culture and gastronomy. To respond to the increase in demand, the last decades have been marked by an increase in the capture of wild sea urchins, but, as demand continued to increase and the capture of wild sea urchins was no longer ecologically sustainable, interest in echinoculture emerged. Various studies have shown positive results on somatic and gonadal growth when feed availability is high, nonetheless, the main obstacles encountered in the production of sea urchins are related to feed: difficulty in finding the balance between cost and quality of feed, limited growth due to inadequate diets and poorly optimized and efficient feeding regimes. Thus, it is essential to provide a high-quality feed since the main goal is to maximize production and obtain a final product of high commercial value. The aim of the present study was to determine the effects of two inert diets on somatic and gonadal growth of P. lividus, and to investigate the effects of sea urchin density on their feeding regime and somatic growth. For that, three trials were carried out, a 20-weeks nutritional trial under farm-conditions, with 450 sea urchins, and a 10-weeks nutritional trial under laboratory-conditions, with 180 sea urchins to determine the effect of two inert diets, containing 20% Ulva spp., on somatic and gonadal growth of juveniles P. lividus, and a 10-weeks density trial under lab-conditions, with 360 sea urchins, to investigate the effects of rearing density on growth and nutritional performances. At the end of the trials, P. lividus juveniles fed with inert diets showed higher total wet weight gain (TWWG), higher total specific growth rate (TSGR) and higher gonadosomatic index (GSI) than those fed with fresh Ulva spp. Sea urchins fed with inert diets showed 6 to 7 times lower feed conversion ratios (FCR) and 3 to 4 times higher protein efficiency ratios (PER) than sea urchins fed with fresh Ulva spp. The rearing density (268 ind.m-2) had no impact on growth and nutritional performance of the sea urchins. This study has shown that inert diets containing 20% Ulva spp. are adequate for an echinoculture, under farm or lab-conditions. The diets were able to enhance somatic and gonadal growth, nutritional performance and with none detrimental impact in sea urchins’ health.
- As perceções dos educadores de infância face à educação sexual com crianças com necessidades educativas específicasPublication . Custódio, Marta Sofia Mateus; Luísa, Cláudia; Beliz, VâniaA educação sexual é uma temática importante, pois a sexualidade é algo natural e integrante da vida do ser humano e contribuí para a sua identidade e para o seu bem-estar físico e psicológico. Não obstante, na educação pré-escolar não é obrigatória a integração da educação sexual no currículo, nem existem indicações sobre a diferenciação com crianças com Necessidades Educativas Específicas (NEE). De forma a contribuir para o aumento do conhecimento sobre a temática, realizou-se uma investigação de carácter qualitativo, que pretendia estudar as perceções dos educadores de infância em relação à educação sexual com crianças com NEE. Recorreu-se à técnica da entrevista semiestruturada aplicada a seis educadoras de infância de uma Instituição Particular de Solidariedade Social (IPSS), do distrito de Faro. Os resultados mais significativos revelam que os educadores de infância apresentam pouca formação sobre educação sexual, o que leva também a que haja uma reduzida implementação de programas de educação sexual na sua prática pedagógica. Referem igualmente que há pouca comunicação com os pais sobre a temática da educação sexual. No entanto, transmitem experiências e reflexões bastantes enriquecedoras decorrentes da sua prática profissional.
- Assessment of source populations for stranded adult loggerhead turtles (Caretta caretta) in the North-East AtlanticPublication . Galatoulas, Adam Pantelis; Castilho, Rita; Cunha, ReginaMaritime activities impact the natural migratory routes of marine organisms such as marine mammals and turtles. The coastal waters of Portugal are in the pathway of such routes for loggerhead turtles (Caretta caretta). While the local upwelling provides foraging grounds, there are no nesting beaches adjacent to the Iberian coast, offering an excellent opportunity to study the migration of the species. This study is the first report of the natal origins of loggerheads in the North-East Atlantic Ocean. We attempted to investigate the genetic diversity of 194 loggerhead turtles found stranded across the Portuguese coast and to assess the origin of individuals through many-to-one mixed-stock analysis. We successfully produced 16 haplotypes of 776 bp of mitochondrial DNA control region for 127 samples and detected a previously unknown haplotype. Comparison with baseline data from distinct nesting populations of the Mediterranean Sea, Cape Verde Islands and the North-West Atlantic Ocean revealed that most of the loggerheads originated in the North-West Atlantic and to a smaller degree in Cape Verde and the Mediterranean. In particular, the Gulf of Mexico in the North-West Atlantic yielded the largest part of the samples and specifically the Florida rookeries: Canaveral National Seashore, Melbourne Beach, Juno beach and Ft Lauderdale. Furthermore, this study highlights the important role of currents in the long journeys of turtles, since most of the contributing rookeries were along such currents. In conclusion, our results signify the need for conservation measurements like turtle excluder devices, tag tracking and fishing management in Portugal, where migratory species, like the loggerhead turtles, are vulnerable.
- A importância das histórias para a infância no desenvolvimento lexical das crianças: perceções das educadoras de infânciaPublication . Agostinho, Jéssica Alexandra Lascas; Correia, Ana Catarina Baptista Jesus; Rodrigues, Susana Filipa ViegasAs histórias para a infância têm sido objeto de grandes discussões entre os especialistas, pois o facto de este tipo de literatura ser direcionado para crianças faz com que estas obras literárias possam ser menos valorizadas. O desenvolvimento lexical é um processo que se inicia desde cedo na vida das crianças e o mesmo prolonga-se por toda a vida, sendo influenciado por vários fatores, nomeadamente as vivências e experiências das crianças. Com este estudo pretendeu-se averiguar qual a importância das histórias para a infância no desenvolvimento do vocabulário das crianças, a partir da análise das perceções de seis educadoras de infância da instituição onde foi realizada a Prática de Ensino Supervisionada. A recolha das perceções das participantes do estudo foi realizada a partir de inquéritos por questionários e uma entrevista de aprofundamento, sendo posteriormente os dados obtidos sujeitos a uma análise e triangulação dos resultados. Os resultados evidenciaram que as educadoras de infância têm consciência da importância das histórias para a infância como promotoras do vocabulário das crianças e que estas demonstram preocupação em incluir a leitura destas histórias ao longo das suas práticas pedagógicas, utilizando algumas estratégias de leitura.
- Menstruação e higiene menstrual - desafios das mulheres com deficiência intelectualPublication . Gomes, Marta Salas; Luísa, Cláudia Cristina Guerreiro; Ferreira, Vânia Maria BelizDurante muito tempo a menstruação e o ciclo menstrual foram ignorados e ridicularizados promovendo estigmas e preconceitos, condicionando a saúde de quem menstrua e o seu bem-estar a nível global. Nas pessoas com perturbação do desenvolvimento intelectual (PDI) está realidade ainda é mais complexa, pois os desafios e vivências envoltos em situações desagradáveis aumenta. É necessário dignificar este processo e eliminar a desinformação existente em torno do mesmo, permitindo que todas as pessoas, vivenciem a sua menstruação de forma segura, confortável e saudável, independentemente da cultura onde estas pessoas se inserem. Esta investigação teve como objetivo geral investigar os conhecimentos que a mulher com perturbação do desenvolvimento intelectual ligeira tem acerca do ciclo e higiene menstrual. Esta investigação surgiu através da questão de partida: Qual a perceção que a mulher com perturbação do desenvolvimento intelectual ligeira tem face à sua menstruação? e permitiu conhecer as principais dificuldades destas mulheres em relação ao seu corpo e higiene menstrual e verificar a desinformação existente perante esta temática. Foi realizada uma investigação qualitativa, utilizando a entrevista semiestruturada e a respetiva análise de conteúdo, sendo aplicada a uma amostra de 6 mulheres com perturbação do desenvolvimento intelectual ligeira, a média das suas idades é de 36 anos e os intervalos encontram-se entre os 19 e os 48 anos de idade. As mulheres que constituem a amostra são clientes de uma instituição particular de solidariedade social, sediada no concelho de Tavira, cujo a missão é apoiar pessoas com deficiência e incapacidades. e as suas famílias, bem como outros públicos vulneráveis. Nas principais conclusões deste estudo é possível constatar que ainda existem vários preconceitos associados à menstruação que fazem com que esta temática não seja abordada com naturalidade e por isso envolta em desinformação e ideias erróneas prejudiciais à saúde sexual reprodutiva.
- Utilização de bobinas de teste para análise do fluxo homopolar em transformadores trifásicosPublication . Bento, João Filipe de Brito; Oliveira, L. M. R.Os transformadores são dos equipamentos mais essenciais e vitais da rede elétrica, constituindo um componente fundamental nos processos de produção, transporte e distribuição de energia elétrica. Ao longo da sua vida o transformador está sujeito a esforços térmicos, mecânicos e eletromagnéticos, os quais, atuando individualmente ou em conjunto, contribuem para o envelhecimento do sistema de isolamento, podendo os danos cumulativos que ele sofre provocar a falha total do transformador. Têm sido propostos e investigados diversos métodos de monitorização continua, que permitem detetar os defeitos, ainda em face incipiente, e evitar a sua progressão para incidentes de dimensão catastrófica. Um dos métodos bastante promissor para verificar o estado de funcionamento do transformador, consiste na monitorização do fluxo magnético de fugas, utilizando bobinas de teste para esse efeito. Este trabalho tem como objetivo efetuar uma análise exploratória sobre as alterações que se verificam na distribuição do fluxo homopolar nos transformadores trifásicos em função dos desequilíbrios da carga, da assimetria da tensão de alimentação e da ocorrência de defeitos internos. Pretende-se averiguar inicialmente se é possível detetar alterações na distribuição do fluxo homopolar com recurso a utilização das bobinas de teste. Esta variação, se detetável, pode servir para identificar a ocorrência de um defeito. São apresentados resultados experimentais e de simulação, onde se analisam casos de estudo com diversas condições de funcionamento, onde se inclui a influência do tipo de ligação dos enrolamentos, a presença da cuba e do enrolamento terciário.
- As funções executivas em crianças diagnosticadas com PDIPublication . Mayer , Tayná Stefany Soledade; Silva, Dina Lúcia Gomes daA Perturbação de Desenvolvimento Intelectual (PDI) pode ser definida como uma alteração no curso do desenvolvimento típico esperado, marcada por um desenvolvimento intelectual insuficiente. Tendo em conta a importância das funções executivas na aprendizagem e no ajustamento social dos sujeitos, tornou-se importante desenvolver uma investigação no sentido de descrever estas funções em crianças referênciadas com PDI. Assim, esta pesquisa teve por objetivo aferir qual o perfil das funções executivas em crianças acometidas pela PDI. Os componentes das funções executivas testados neste trabalho foram, memória de trabalho, flexibilidade cognitiva e controlo inibitório. Este é um estudo descritivo, no qual a amostra estudada foi composta por crianças de 8 aos 11 anos de idade diagnosticadas com PDI. Foram administrados os seguintes instrumentos Children`s Color Trails Test (CCTT), Frontal Assessment Battery (FAB) e o Memória de Dígitos (WISC-III). A amostra apresentou um desempenho abaixo da média em em todos os instrumentos administrados. Dentre as variavéis estudadas a que melhor explicou o desempenhos dos sujeitos foi a idade e escolaridade, no entanto, estes factores mostraram-se significativos somente quando relacionados aos resultados obtidos no CCTT, indicando que são factores explicativos somente da flexibilidade cognitiva. Os dados obtidos leva-nos a concluir que as funções executivas, em crianças acometidas com PDI, estão alteradas de forma acentuada, sobretudo a flexibilidade cognitiva, no entanto, o desenvolvimento acarretado pelo avanço da idade e a inclusão no sistema formal de ensino propiciam melhorias na performance em atividades que demandam a flexibilidade cognitiva.