Comprehensive analysis of genetic variants in the MYBPC3 gene: databases, variants and structural impact

Gomes, Ana Letícia Fernandes

Publication

Comprehensive analysis of genetic variants in the MYBPC3 gene: databases, variants and structural impact

2024-12-03Master thesis

datacite.subject.fos	Ciências Médicas::Outras Ciências Médicas
dc.contributor.advisor	Bruque, Carlos David
dc.contributor.advisor	Martel, Paulo
dc.contributor.author	Gomes, Ana Letícia Fernandes
dc.date.accessioned	2025-07-31T10:40:31Z
dc.date.available	2025-07-31T10:40:31Z
dc.date.issued	2024-12-03
dc.description.abstract	Hypertrophic Cardiomyopathy (HCM) is the most common inherited cardiomyopathy and genes encoding sarcomere proteins have been reported to be the primary cause of the disease. MYBPC3, encoding cardiac myosin binding protein C (MyBP-C), is the first candidate gene to study genetic cases in HCM. MyBP-C is a sarcomeric protein that binds to both actin and myosin, and regulates cardiac contractility. Due to the increasing number of variants described in MYBPC3, a better understanding of the disease-causing mechanisms and correct interpretation of the biological implications are required when determining its pathogenicity. Here, we create an extensive dataset, from the literature between 1995 and 2017, containing information about pathogenic MYBPC3 variants. A total of 106 articles containing information on MYBPC3 pathogenic variants were assembled. The next step was, curate the nomenclature, according to the Human Genome Variation Society (HGVS) and Mutalyzer 3 (https://mutalyzer.nl/). Additionally, all variants from the literature dataset were reclassified according to the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) guidelines. The assembling of 603 MYBPC3 genomic variants from previous publications enables us to standardize the variants to the same terminology, reduce redundancy, and identify MYBPC3 genotype-phenotype correlations. The final analysis of our work focuses on missense variants and their possible impact on MyBP-C protein. Our findings provide strong support on pathogenicity for missense variants, through protein structure destability and influence MyBP-C protein important binding sites.	eng
dc.description.abstract	Doenças não transmissíveis (DNTs), também conhecidas como doenças crónicas, são condições médicas associadas a uma longa duração e geralmente a um progresso lento, como por exemplo, doenças cardiovasculares (DCVs), diabetes, doenças respiratórias crônicas e cancro. De acordo com a Organização Mundial de Saúde (OMS), DNTs são a principal causa de morte mundialmente, responsáveis por 41 milhões de mortes anualmente, o que corresponde a 74% de todas as mortes globalmente. Doenças cardiovasculares (DCVs) são consideradas uma das doenças mais mortais em todo o mundo e afetam a estrutura ou a função do coração, como por exemplo, a doença coronária, insuficiência cardíaca, arritmias, doença da aorta, doença cardíaca congénita, ataques cardíacos, doenças do músculo cardíaco (cardiomiopatias), acidente vascular cerebral (AVC), doenças vasculares e outras condições. Doenças cardiovasculares (DCVs) podem frequentemente resultar em casos não tratados e não detetados, manifestando-se na forma de morte súbita cardíaca e inesperada (MSC). MSC tem várias causas e são destacadas como uma das principais prioridades de saúde pública, pois são responsáveis por um grande número de mortes prematuras em todo o mundo. Na população mais envelhecida, as doenças estruturais crónicas são predominantes, como a doença coronária e cardiomiopatias. Existe uma grande proporção de doenças cardíacas súbitas em grupos jovens (menos de 35 anos), o que aumentou a consciencialização para esta questão de saúde. A população jovem enfrenta patologias associadas a doenças estruturais do coração, como cardiomiopatias, que podem ser atribuídas a causas genéticas. A Cardiomiopatia Hipertrófica (CMH) é a cardiomiopatia hereditária mais comum e genes que codificam proteínas do sarcómero têm sido reportadas como sendo a causa primária da doença. MYBPC3, codifica a proteína cardíaca miosina C (cMyBP-C), e é o gene mais frequentemente associado a CMH. cMyBP-C é uma proteína expressa exclusivamente no coração, particularmente no sarcómero cardíaco, que é a unidade básica da contração muscular do coração. cMyBP-C é constituída por 10 domínios (C1-C10) e a sua função pode ser resumida em 2 passos, primeiro permite a contração muscular através de interações com o filamento fino (actina), gerando força contrátil; segundo, controla a disponibilidade da miosina através do filamento grosso. Variantes patogénicas no gene MYBPC3 são fatores determinantes para o fenótipo de CMH. Devido ao aumento do número de variantes genéticas descritas no gene MYBPC3, uma melhor compreensão dos mecanismos que causam CMH e uma correta interpretação de implicações biológicas são necessárias para determinar a sua patogenicidade. (...)	por
dc.identifier.tid	203977726
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10400.1/27521
dc.language.iso	eng
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subject	Cardiomiopatia hipertrófica
dc.subject	Variantes genéticas
dc.subject	Base de dados
dc.subject	Patogenicidade
dc.subject	Estabilidade de proteínas
dc.title	Comprehensive analysis of genetic variants in the MYBPC3 gene: databases, variants and structural impact	eng
dc.type	master thesis
dspace.entity.type	Publication
thesis.degree.grantor	Universidade do Algarve. Faculdade de Ciências e Tecnologia
thesis.degree.level	Mestre
thesis.degree.name	Mestrado em Biologia Molecular e Microbiana