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- Mesozooplankton community dynamics in response to suppressed upwelling: a case study comparing the gulf of panama and the Gulf of Chiriquí using automated image analysisPublication . Becker, Lina; Mendes, Isabel Maria de Paiva Pinto; Schiebel, RalfThis thesis investigates mesozooplankton community dynamics in response to anomalous oceanographic conditions, focusing on the 2025 collapse of the seasonal upwelling in the Gulf of Panama. Using a comparative approach with the neighboring Gulf of Chiriquí, the study integrates semi-automated FlowCam imaging with supervised machine learning classifiers to process over 750,000 plankton images. This methodology enabled reliable abundance, and biomass estimates for dominant taxa, particularly copepods, at resolutions and scales unattainable through traditional microscopy. Hydrographic measurements revealed strongly stratified conditions in the Gulf of Panama, with suppressed nutrient input into the euphotic zone. In contrast, the Gulf of Chiriquí maintained relatively stable conditions. Ecological consequences were profound: the Gulf of Panama, typically characterized by high productivity due to upwelling, exhibited markedly reduced mesozooplankton abundance and biomass. Conversely, the Gulf of Chiriquí showed unexpectedly higher biomass across most depths, highlighting its role as a potential analogue for future oligotrophic states under climate-driven variability. Copepods remained the numerically and functionally dominant group, underscoring their resilience and central role in trophic transfer. However, size-structured analyses revealed that biomass patterns were not solely linked to abundance but strongly influenced by ontogenetic stage distribution. The disproportionate contribution of larger size fractions to carbon stocks emphasizes the importance of monitoring size structure in addition to abundance. Methodologically, the study demonstrates the value of hybrid workflows combining automated imaging with targeted manual curation. Despite challenges such as misclassification of transparent taxa and debris, semi-automated imaging proves scalable and essential for long-term ecological monitoring. Ultimately, the findings provide critical baseline data for understanding mesozooplankton dynamics under anomalous conditions. They highlight both resilience and vulnerability: while copepods persist, the productivity of short food chains may increasingly be at risk in a warming and more variable ocean.
- Investigating the role of frequency-dependent pre-conditioning to low oxygen and pH in building coral stress tolerancePublication . Littke, Sophie; Schoepf, Verena; Engelen, AschwinSevere hypoxia, often coupled with low pH, is an emerging threat to coral reefs, yet their combined effects, and the potential for environmental priming to modulate coral responses under such stress, remain understudied. In particular, the frequency and timing of prior sublethal exposure to combined low oxygen and pH are largely unexplored as drivers of coral stress tolerance. We conducted a controlled laboratory experiment to test how the frequency of nightly low dissolved oxygen (DO) and pH exposure shapes physiological responses of two Caribbean coral species, Agaricia tenuifolia and Siderastrea siderea, during subsequent, acute combined stress. Corals received six (high frequency, HF), three (low frequency, LF), or no (control) priming pulses, each lasting two consecutive nights, over four weeks, mimicking natural diel DO and pH cycles in shallow reefs, followed by 4–7 days of acute stress or ambient conditions. Results revealed contrasting species-specific outcomes. In A. tenuifolia, HF priming reduced baseline photosynthetic efficiency by 32% by the end of the priming period, with no further change during acute stress. HF primed A. tenuifolia also exhibited a ~42% reduction in symbiont densities, and a nearly tenfold increased risk of tissue loss compared to controls, regardless of acute stress treatment, while biomass and calcification remained unchanged. In contrast, S. siderea showed physiological stability across treatments, with LF priming supporting tissue biomass maintenance under acute stress. By the experimental end, biomass declined 28% and 22% in unprimed and HF-primed corals under acute stress, respectively, whereas LF primed corals maintained biomass. These findings highlight stress frequency as a critical yet understudied dimension of environmental priming and a direct modulator of baseline coral physiology. HF priming impaired the hypoxia-sensitive A. tenuifolia, while LF priming was neutral. The more hypoxia-tolerant S. siderea showed subtle LF priming benefits and no HF effects. As climate change and coastal eutrophication intensify diel variability and acute low DO and pH events, understanding frequency-dependent stress responses will improve predictions of reef community trajectories and help identify resilient coral populations.
- Medicamentos contendo valproato e medidas adicionais de minimização de risco – conhecimentos e atitudes do farmacêutico comunitárioPublication . Pereira, João Diogo Santos; Ramalhinho, IsabelA farmacovigilância constitui um pilar essencial da segurança do medicamento, sendo as medidas adicionais de minimização de risco (MMRa) fundamentais quando as de rotina se revelam insuficientes. Os medicamentos contendo valproato, devido à sua teratogenicidade, estão sujeitos a várias MMRa como o Programa de Prevenção da Gravidez. O farmacêutico comunitário, enquanto último profissional de saúde em contacto com o utente antes do início da terapêutica, desempenha um papel fundamental na sua efetividade. Este estudo teve como objetivo avaliar os conhecimentos e atitudes dos farmacêuticos comunitários relativamente às MMRa dos medicamentos contendo valproato. Foi conduzido um estudo observacional, transversal, com recurso a um questionário online dirigido a farmacêuticos de farmácias filiadas da Associação Nacional das Farmácias (ANF). A amostra final incluiu 196 farmacêuticos das diferentes regiões do país. Os resultados mostram que 90,8% conhecem as MMRa, sendo a rotulagem/embalagem especial (75,5%) e as Comunicações dirigidas aos Profissionais de Saúde (65,8%) as mais conhecidas. Contudo, apenas 38,3% conhece o Programa de Prevenção da Gravidez e 29,2% as medidas destinadas a homens em idade fértil. Ainda existem 11,7% de farmacêuticos que não utilizam qualquer medida no ato de dispensa, alegando principalmente desconhecimento e dificuldade de acesso. Relativamente às atitudes na dispensa, 80,6% aconselha sobre contraceção eficaz e 77,6% referenciam para consulta médica em caso de suspeita de gravidez, embora 9,2% não presta qualquer aconselhamento. Os farmacêuticos comunitários revelam elevado conhecimento global, mas persistem lacunas em medidas específicas e recentes. O reforço formativo e a integração de alertas nos sistemas informáticos poderão aumentar a adesão às MMRa e garantir o uso seguro dos medicamentos.
- Green extraction technique using natural deep eutectic Solvents (NADES) and supramolecular solvents (SUPRAS) to recover bioactive compounds from medicinal halophyte Polygonum Maritimum L.Publication . Udoji, Mmaduabuchi Desmond; Custódio, Luisa; Lopes, André D.A extração sustentável de compostos bioativos de alto valor a partir de recursos naturais continua sendo um desafio crítico na química verde. Este estudo avalia a eficácia dos Solventes Eutéticos Profundos Naturais (NADES) e dos Solventes Supramoleculares (SUPRAS) como alternativas inovadoras e sustentáveis aos solventes convencionais para a extração de compostos fenólicos e alcaloides de Polygonum maritimum, uma planta com potencial bioativo pouco explorado. Quatro sistemas NADES e dois SUPRAS, incluindo suas formas em equilíbrio e híbridas, foram avaliados utilizando extração assistida por ultrassom (UAE) e comparados com etanol e água como solventes de referência. Entre os solventes testados, a mistura Cloreto de colina: ácido lático (CC:LA) apresentou a maior atividade antioxidante no ensaio DPPH, com um valor de IC₅₀ de 0,0281 ± 0,014 mg/mL, superando significativamente o Cloreto de colina: ácido málico (CC:MA). Esses resultados foram corroborados pelas medições do teor total de flavonoides (TFC) e pela análise por LC-MS, confirmando a presença de diversos compostos fenólicos. Embora o etanol tenha extraído a maior quantidade total de bioativos, os NADES e SUPRAS demonstraram enriquecimento seletivo e recuperação de compostos fenólicos específicos e alcaloides. Este estudo ressalta a integração promissora dos NADES e SUPRAS com UAE como uma abordagem ecoeficiente e escalável para a extração de produtos naturais valiosos de plantas marinhas.
- Whistle structure and geographical variations in three delphinid species recorded in eastern Algarve CoastPublication . Gil, Susana; Jesus, Sérgio Manuel Machado; Soares, CristianoThis study aims to characterize and compare the whistle repertoires of three odontocete species, Delphinus delphis (short-beaked common dolphin), Tursiops truncatus (common bottlenose dolphin), and Pseudorca crassidens (false killer whale), in the coast of Faro. This knowledge is essential for their monitoring and conservation, particularly for this region. Especially because this is an area with high anthropogenic pressure and limited prior research. These species were chosen due to their presence in the region and high vocal activity, with special emphasis on the poorly studied false killer whale (Pseudorca crassidens), recently observed using the area as a seasonal feeding ground. Recordings were obtained between April 2022 and June 2024 using an opportunistic platform during dolphin and whale watching surveys. A total of 36 acoustic events were analyzed. Visual analysis and manual whistle extraction of ten acoustic parameters were conducted using Raven Pro: beginning, end, minimum, and maximum frequency, frequency range, duration, initial and final slope, number of inflection points, and number of steps. In total 327 whistles were analyzed and used in this study. Whistle contours were also categorized into six standard types according to previous studies (Constant, Upsweep, Downsweep, Convex, Concave and Sine). Statistical analyses were conducted to describe and categorize the repertoire of the three species. A non-parametric Kruskal-Wallis’ test was used to determine overall differences in whistles parameters among species, pairwise with Dunn’s test and adjusted with sequential Bonferroni. A non-metric multidimensional scaling (NMDS) was used to visualize acoustic separation between species. The whistles contours were also compared using a correlation matrix. Additionally, a Random Forest model measured the classification performance and the importance of each acoustic variable. Results showed significant acoustic differences in whistle parameters between species, especially between Pseudorca crassidens and the two other dolphin species. Delphinus delphis and Tursiops truncatus showed higher variability in frequency and contour type, potentially related to behavioral context or social structure. To explore potential geographic variation, Faro data was compared with published values from other geographic regions to evaluate possible geographic divergence using mean values of frequency parameters available in literature. Geographic comparisons revealed that the population of Faro exhibits distinct whistle characteristics when compared to populations from other regions. The results also showed that geographic distance alone does not predict acoustic similarity or divergence. Instead, environmental context plays a key role in shaping dolphin’s repertoire, likely driving specific acoustic adaptations. These findings contribute to baseline knowledge of local cetacean acoustic repertoires and highlight the importance of passive acoustic monitoring for population, behavioral, and conservation studies. This work reinforces the importance of regional characterization to detect alterations related to human activity and environmental change, and it supports future efforts to implement effective mitigation and management strategies for cetacean conservation in southern Portugal.
- Oceanography data acquisition and analysisPublication . Robledo, Ivan Piquer; Gauci, Adam; Fernandez, HelenaDetailed bathymetry is necessary for reliable coastal zone management and operations. While traditional in-situ echo sounding offers high precision, it suffers from inefficiencies in shallow waters and incurs logistical costs. Similarly, LiDAR mapping provides efficient coverage of coastal areas but comes with high acquisition expenses. In contrast, Satellite Derived Bathymetry presents a more cost-effective alternative for mapping coastal regions, albeit typically at a lower resolution. This study addresses the need for precise shallow water bathymetry around the Maltese Islands by integrating in-situ and remote data from Landsat 9, Planet Scope and Sentinel 2-A satellites. We investigate both conventional linear regression models and advanced machine learning techniques, specifically the Random Forest algorithm. An empirical workflow was developed from various band combinations, calibrated against extensive on-site measurements. The research provides a comprehensive insight into the depth accuracy achievable for shallow coastal regions using these diverse satellite platforms and modeling approaches, contributing to more efficient and reliable bathymetric mapping for coastal applications.
- Stage-specific responses of Senegalese sole postlarvae to micro- and macroalgae dietary blendsPublication . Oliveira, Carolina Salgueiro Brinca Freitas de; Engrola, Sofia; Teodósio, RitaImproving robustness of postlarval fish through diet is a priority in hatchery production, with macro- and microalgae emerging as bioactive functional ingredients whose impacts can vary with developmental stage and composition. This study evaluated the effects of dietary supplementation with combinations of macroalgae (Ulva sp.) and microalgae (Tisochrysis lutea or Pavlova gyrans) on growth performance, oxidative status, and immune resilience in Senegalese sole (Solea senegalensis) postlarvae. Three experimental diets were tested: a CTRL, similar to a commercial diet; and two diets consisting of the CTRL diet supplemented with biomass of Ulva sp. combined with either T. lutea (ULTISO) or P. gyrans (ULPAVL). Growth performance parameters were assessed until 38 DAH. Following this period, fish were exposed to a short-term immune-boosting dietary intervention containing Skeletonema costatum (BOOST) prior to transport and bacterial challenge with Tenacibaculum maritimum. Results showed that ULPAVL-fed fish exhibited significantly lower growth performance (dry weight and total length) compared to the control and ULTISO groups, which performed similarly. Oxidative status analysis at 38 DAH revealed increased superoxide dismutase and catalase activities in the ULTISO group, whereas lipid peroxidation was significantly reduced in ULPAVL-fed fish. Despite administration of the BOOST diet, no significant differences in oxidative markers or related gene expression were observed across treatments at 45 DAH. Moreover, gene expression of catalase and claudin 15 was downregulated in the ULTISO group after infection, suggesting impaired antioxidant defense and epithelial integrity. These results highlight the complexity of using algae-derived additives in larval fish diets and emphasize the importance of formulating stage-specific feeds tailored to the developmental status of the fish, in order to promote growth potential while enhancing robustness. Future research should focus on optimizing both the composition and inclusion levels of algae to support performance and resilience in marine aquaculture systems.
- Utilização de niacinamida na abordagem cosmética da hiperpigmentaçãoPublication . Fontinha, Maria Inês dos Santos Pedrosa; Nascimento, TâniaA hiperpigmentação cutânea é uma condição dermatológica comum, caracterizada pelo aumento da produção e acumulação de melanina na pele, manifestando-se através de manchas escurecidas. Esta condição pode ser desencadeada por diversos fatores, como a exposição solar, inflamação ou utilização de certos fármacos. O tratamento tradicional envolve o uso de agentes farmacológicos, como a hidroquinona, que podem apresentar irritação cutânea e outros efeitos adversos. Neste contexto, a niacinamida emerge como um ingrediente cosmético promissor, com uma ação despigmentante, complementada pelas suas propriedades antioxidantes, anti-inflamatórias e antienvelhecimento. A presente dissertação teve como objetivo explorar a eficácia da niacinamida como um ativo cosmético para o tratamento da hiperpigmentação da pele. A metodologia da tese consistiu numa revisão bibliográfica de estudos clínicos e experimentais, analisando a eficácia, os mecanismos de ação e a segurança da niacinamida em diversas formulações. Os resultados da análise demonstram que a niacinamida é um ingrediente promissor e eficaz no tratamento da hiperpigmentação. A sua ação principal é a inibição da transferência de melanossomas dos melanócitos para os queratinócitos. Adicionalmente, a niacinamida atua na modulação precoce da resposta inflamatória e na regulação epigenética. Os estudos analisados também indicam que a niacinamida é um ingrediente bem tolerado, com baixo risco de efeitos adversos, o que a torna uma alternativa segura a outros agentes despigmentantes mais agressivos. Em conclusão, a niacinamida emerge como uma solução eficaz, segura e versátil na abordagem cosmética da hiperpigmentação, quer como tratamento principal, quer em combinação com outros ativos. A sua eficácia despigmentante e a sua boa tolerabilidade justificam a sua crescente relevância na indústria cosmética. É fundamental que a aplicação de niacinamida seja acompanhada pelo uso diário de protetor solar para maximizar os seus benefícios e prevenir o agravamento da hiperpigmentação.
- Abordagem farmacológica da doença de huntingtonPublication . Paquim, Diana Malho; Serralheiro, Ana IsabelA Doença de Huntington é uma doença neurodegenerativa autossómica dominante que resulta da expansão da repetição trinucleotídica CAG no gene huntingtina. Esta mutação conduz à produção da proteína huntingtina mutada cujo processo de folding é anómalo. A proteína acumula-se nos neurónios desencadeando processos de disfunção mitocondrial, excitotoxicidade, alterações na reparação do DNA, desregulação transcricional, comprometimento da autofagia e do sistema do proteossoma. Esta patologia manifesta-se clinicamente através de sintomas motores, cognitivos e psiquiátricos que vão piorando progressivamente. O diagnóstico baseia-se no histórico familiar, em testes genéticos e exames de imagem cerebral que permitem a deteção de alterações estruturais e funcionais anteriores ao desenvolvimento dos sintomas. Apesar de não existir um tratamento curativo, existe uma grande diversidade farmacológica que permite um controlo sintomático através de, por exemplo, inibidores do transportador vesicular de monoamina 2 (ex.: tetrabenazina), antipsicóticos, antidepressivos e moduladores dos recetores de glutamato. A abordagem farmacológica deve ser complementada com medidas não farmacológicas como, fisioterapia, terapia ocupacional e terapia da fala para promover a qualidade de vida do doente. Nos últimos anos, têm sido estudadas novas estratégias terapêuticas como oligonucleótidos antissentido, RNA de interferência, edição genética, terapia celular e anticorpos monoclonais que demonstraram potencial no atraso da progressão da doença e, possivelmente, na modificação do seu curso natural. Esta dissertação apresenta uma revisão abrangente da fisiopatologia, diagnóstico, terapêutica atual e perspetivas terapêuticas futuras, salientando a importância da investigação e dos ensaios clínicos em curso para o desenvolvimento de tratamentos modificadores da doença.
- Indicações terapêuticas dos inibidores da aromatase: revisão da literatura e perspetivas futurasPublication . Dartu, Dragos Florentin; Conceição, Jaime Manuel Guedes Morais daAtualmente, os inibidores da aromatase são uma classe de fármacos usados principalmente no tratamento de situações oncológicas, particularmente em mulheres, no caso do cancro da mama. A aromatase é a enzima que catalisa a conversão de androgénios em estrogénios, estando presente em vários tecidos e órgãos do organismo, como tecido adiposo, ovários, tecido ósseo, cérebro e células malignas, sendo a sua função regulada de forma distinta em cada tipo de tecido. A obesidade é um problema de saúde mundial crescente, com tendência a aumentar, bem como a esperança média de vida, pelo que patologias e fatores psicológicos e fisiológicos associados ao envelhecimento têm maior prevalência. As indicações terapêuticas dos inibidores da aromatase atuais visam o tratamento e prevenção da recidiva cancerígena, no entanto, o efeito terapêutico pode ser utilizado para situações diferentes como a obesidade, tendo por base o conhecimento sobre a aromatase, bem como o seu uso “off-label”. Com base nas considerações anteriores, o objetivo da presente dissertação foi retratar as indicações terapêuticas dos inibidores da aromatase e apresentar o funcionamento da aromatase no organismo como um todo, o impacto que apresenta na saúde e como isso pode ser explorado, com base no perfil de segurança avaliado em situações oncológicas, para diferentes situações como a obesidade. Considerando o perfil de segurança dos inibidores da aromatase, o mecanismo apresentado e possível benefício, seria uma mais-valia a realização de alguns estudos com variáveis a avaliar do foro neuro-cognitivo, endocrinológico e fisiológico, nomeadamente massa corporal gorda, magra e óssea.