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- Gene expression response of Chondrilla nucula to a simulated marine heat wave eventPublication . Paone, Carlotta; Castilho, Rita; Kaitetzidou, ElisavetSessile marine organisms are particularly susceptible to stress conditions due to their reduced mobility. The identification of early biomarkers in response to climate change scenarios as indicators for stress thresholds can provide fundamental understanding in prevention of necrosis or symbiotic disruptions between and within species. Porifera have shown incredible evolutionary adaptability, and are integrated into diverse marine ecosystems, playing important roles in their functioning. Chondrilla nucula Shmidt 1862, a marine sponge, represents an abundant population within the benthic community of the Mediterranean Sea. mRNA sequencing and de novo transcriptome assembly techniques were implemented on this non-model species in order to investigate the gene expression dynamics of Chondrilla nucula in response to elevated temperatures, simulating a recent marine heat wave event. Differential expression and functional annotation analysis has induced the expression of genes involved in metabolic activity, binding processes, and regulation of biological functions. This has provided insight into the mechanisms of stress response and adaptation, which may contribute to better management and conservation of sponge ecosystems under future climate conditions.
- Sedimentological characterization of a sedimentary record from the Portimão Bank (SW Iberia): Late Quaternary-Holocene paleoenvironmental implicationsPublication . Martins, Mélinda; Veiga-Pires, Cristina; Ercilla, Gemma; Drago, TeresaOver the centuries, Earth's oceans have served as repositories of invaluable historical data within their sedimentary layers. Deep-sea sedimentary archives collected through sedimentary cores constitute essential reservoirs of complete information for the reconstruction of paleoenvironments. The present study focuses on the re-examination of a sedimentary core, piston core named PC06, extracted at the base of the Portimão bank, located southwest of the Iberian margin. This core spans the last 49,000 years of Earth's history and was collected at a depth of 3 520 meters of water as part of the Spanish MONTERA project, entitled “Seamounts of the Southern Iberian Peninsula: tectonics and sedimentation” (CTM 2009-14157-C02 CSIC). The main objective of this work was to identify and characterize the paleoenvironmental conditions prevailing during this period, through a multidisciplinary study, including sedimentological, mineralogical, and geochemical analyses. Our analysis reveals environmental changes close to Portimão Bank during the Late Pleistocene and Holocene. Four lithofacies define distinct sedimentary units, reflecting conditions dating from 49,000 years BP to the present. Notable periods, including the Last Glacial Maximum and the Holocene, highlight the impact of climate, sea level changes, and ocean circulation and productivity on sediment characteristics. The study emphasizes the role of bottom currents and their potential link to deep water flow in the North Atlantic, and the presence of pyrite throughout the sedimentary record indicates the impact of anoxic conditions, influencing the transition from an anoxic environment to a well-oxygenated environment. Furthermore, the study highlights the complexity of deep-water transport, highlighting the influence of the Portimão Bank on sedimentation patterns. Overall, the analysis provides a nuanced understanding of the environmental evolution of the Portimão Bank over the past 49,000 years. These findings have broader implications for our understanding of past climatic and oceanographic conditions and their impact on sedimentation processes in this region.
- Study on the impact of cetacean watching in the AlgarvePublication . Freitas, Francisco Cardoso de; Castilho, RitaAs pressões antropogénicas impactam profundamente a natureza e são uma preocupação central dos conservacionistas. Espécies emblemáticas, como os cetáceos, não são uma exceção. Ao longo de grande parte dos séculos XIX e XX, os cetáceos foram considerados um recurso a ser colhido devido aos diversos produtos extraídos destes mamíferos. Esta captura em grande escala de mamíferos marinhos atingiu o seu pico em 1960, com os navios-fábrica, e esteve perto do fim na década de 1980, quando as populações de baleias ficaram gravemente ameaçadas. Finalmente, em 1986, a Comissão Baleeira Internacional (CBI) declarou uma moratória sobre a caça comercial de baleias, destinada a proteger as baleias da ameaça de extinção. Desde esta moratória, a interação predominante entre cetáceos e humanos mudou completamente na maior parte do globo. Atualmente, existe um forte apoio em grande parte do mundo para tratar as baleias como um bem público global intrinsecamente valioso que deve ser protegido para o benefício do planeta. A observação de baleias é uma indústria de turismo baseada na natureza que se desenvolveu nos Estados Unidos durante a década de 1950. A observação de baleias é uma atividade que assenta na observação de espécies de cetáceos; todos os grupos de cetáceos são alvo desta atividade, incluindo Mysticeti e Odontoceti. A observação de baleias geralmente envolve passeios de barco, mas é também possível observar baleias de terra ou por via aérea (helicóptero ou avião). Os levantamentos terrestres também são considerados parte desta indústria, especialmente em locais onde as baleias estão muito próximas da costa, permitindo a observação a partir de pontos de vista bem posicionados, muitas vezes promovidos pelo turismo local. As ameaças à maioria das espécies de cetáceos ainda não são completamente compreendidas. Em 2008, havia tão poucos dados disponíveis sobre cetáceos que mais de metade das espécies foram classificadas, na categoria de dados deficientes, pela União Internacional para a Conservação da Natureza (UICN). Portugal continental tem potencial para a observação de golfinhos, tal como previsto no relatório de 2001 do Fundo Internacional para o Bem-Estar Animal (FIBA). Desde um início lento em 1998, com 1.380 observadores de baleias, para em 2008, mais de 58.000. A atividade comercial de observação de baleias ou golfinhos, em Portugal continental, aumentou dramaticamente de 11 empresas em 2008, para 45 apenas na região do Algarve no ano de 2022. As operações marítimo-turísticas não regulamentadas e mal supervisionadas podem causar impactos negativos nas populações de cetáceos, que podem ser agravados pelo aumento acentuado do número de operadores turísticos. As investigações sobre cetáceos têm dois modelos de atuação distintos os dados podem ser recolhidos através de plataformas dedicadas à investigação ou através de plataformas oportunistas. A maior parte dos dados recolhidos no Algarve e em Portugal continental têm origem em observações oportunistas. A falta de conhecimento e estudo sobre a abundância e distribuição de cetáceos no Algarve dificulta as possíveis medidas de mitigação dos impactos antropogénicos nestas espécies emblemáticas. Como tal, a observação de baleias em contexto turístico é uma solução alternativa, proporcionando plataformas de investigação oportunista, para investigadores de cetáceos, financiadas por turistas. No geral, apesar dos dados oportunistas apresentarem grandes limitações que podem afetar a fiabilidade dos resultados, devido a limitações como a detetabilidade de diferentes cetáceos, a proximidade dos animais ou o tempo limitado por viagem devido a restrições empresariais ou legislativas. Os benefícios podem superar as limitações, uma vez que proporciona plataformas de pesquisa de baixo custo que de outra forma não estariam disponíveis. Estas plataformas provaram-se fulcrais para o nosso estudo, fornecendo novos conhecimentos sobre locais com falta de dados, como é o caso do Algarve. Como tal, no nosso estudo decidimos implementar duas metodologias oportunistas, com o intuito de combater a falta de dados sobre os cetáceos da região. Estas técnicas de investigação, foram as observações marinhas, onde os investigadores recolhiam dados em embarcações marítimo-turísticas, bem como as observações costeiras, feitas através de binóculos colocados em pontos vantajosos da costa algarvia, como faróis ou falésias. A distribuição dos cetáceos e a forma como utilizam os habitats são de enorme importância no esforço de conservação. A distribuição dos cetáceos é muito influenciada pela batimetria, ou seja, pela proximidade da costa e pela profundidade das águas, bem como pela quantidade de embarcações presentes na área. Estas variáveis oceanográficas apresentam diferenças significativas em todo o Algarve, particularmente entre as nossas duas áreas de estudo: a costa de arribas rochosas de Vilamoura, com águas mais rasas maioritariamente abaixo dos 50m e a região de Faro com profundidades até 500m. Como tal, no nosso estudo tivemos uma prevalência de espécies costeiras, tais como o roaz-corvineiro (Tursiops truncatus) e o golfinho-comum (Delphinus delphis). Também as variáveis antropogénicas recolhidas revelaram diferenças entre Vilamoura e Faro, sendo que estas áreas foram classificadas, respetivamente, como zonas de grande e pequeno impacto. Os levantamentos de barco incluídos numa atividade turística proporcionaram-nos conhecimentos importantes sobre a distribuição dos cetáceos, utilização do habitat, abundância e diversidade de espécies em duas áreas adjacentes, mas distintas do Algarve. Os levantamentos de barcos também permitiram comparar diferentes abordagens de observação de baleias em áreas com alta e baixa densidade de barcos (Vilamoura e Faro). Vilamoura, onde a observação de cetáceos é aliada à visita de grutas, revelou-se uma zona de maior impacto para os cetáceos, uma vez que a densidade de embarcações é maior e o cumprimento da legislação é menor, sendo ao mesmo tempo um habitat menos diversificado. As viagens exclusivamente dedicadas à observação de cetáceos em Faro revelaram-se uma abordagem menos invasiva, uma vez que houve menos restrições de tempo, bem como uma mentalidade mais consciente por parte dos responsáveis, que levaram a um melhor cumprimento da lei e consequentemente a uma atividade menos impactante. Os levantamentos terrestres revelaram-se uma metodologia útil para aumentar o conhecimento sobre os cetáceos no Algarve, especialmente quando associados a levantamentos de barco. Esta metodologia também provou ter um grande potencial para ajudar a mitigar os impactos negativos dos cetáceos, especialmente no que diz respeito à aplicação da legislação. Como tal, esta metodologia deveria ser incluída na legislação de observação de cetáceos, tal como acontece nos Açores e na Madeira.
- A DNA barcoding approach to assess coral species richness and biogeographic affinities of Hexa- and Octocorallia in Cabo VerdePublication . Bourhis, Aude Le; Serrão, Ester; Neiva, João; Cabezas, Pilar; Hillebrand, Aschwin Engelen; Coelho, MarcioCoral reefs are the most biodiverse marine ecosystems on earth. Often described as biodiversity hotspots, they cover less than 1% of the ocean floor but host more than 25% of all marine species. However, coral reefs are undergoing massive degradation around the world, prompting a need for further studies on global coral populations to support their protection. Tropical reefs in particular, are essential for biodiversity but are understudied in many parts of the world and therefore insufficiently understood. This is the case in Cabo Verde, currently listed as 8th among endangered biodiversity hotspots. With less than 1% of national waters protected, the archipelago lacks data and knowledge on its species diversity, a regional tendency for West Africa. Thus, this study aimed to assess shallow coral species richness (< 50m depth) and consolidate current species diversity knowledge within Cabo Verde, to reveal cryptic species before they might become threatened or disappear. While 21 species were morphologically identified, molecular methods were used to build the first DNA barcode library for Cabo Verde’s hexacorals and octocorals. The use of complementary mitochondrial (COX1 and MutS) and nuclear (28S) DNA markers, field identification, and litterature-based species lists helped to successfully identify 27 samples to the species level and three others to the genus level, which previously had only been morphologically identified. Balanopsammia wirtzi constituted a new barcode for the region and the alien species Carijoa riisei was confirmed through barcoding of mitochondrial COI and nuclear 28S genes. Phylogenies confirmed biogeographic affinities of three out of the four dominating hermatypic species (S. radians, P. porites, P. astreoides) to be closely related to the Caribbean. The study also revealed noteworthy differences in species richness between Cabo Verde and the other Macaronesian archipelagos, sharing a few common species throughout the Scleractinia and Antipatharia order and only the species Eunicella verrucosa in the order Alcyonacea. None of the dominating four hermatypic species in Cabo Verde could be found in any other of the Macaronesia islands. This research represents one of the first attempts, and the most exhaustive one to date, to characterize the coral species composition of Cabo Verde using DNA barcoding, and produced a geographically referenced coral DNA catalog baseline that will inform further research, education and conservation initiatives.
- A estrada e a paisagem: a relação entre a estrada e a paisagem como contributo para a valorização do património paisagístico, histórico e culturalPublication . Melo, Pilar Pinheiro de; Baptista, Desidério; Fernandes, Maria JacintaO conceito de estrada paisagística, chegou da América do Norte há mais de um século e a sua aplicação e desenvolvimento está atualmente a ser levado a cabo na Europa. Ao contrário dos Estados Unidos, a ideia de estrada paisagística alcançou a Europa evidenciando a história e cultura do lugar, pois sendo este um território mais pequeno e intensamente ocupado durante mais tempo, é, na maioria, um espaço carregado de elementos e manifestações da presença humana. A estrada paisagística pode alcançar cidades, povos, elementos de património construído e espaços naturais situados no mesmo trajeto. A relação entre estrada e paisagem tem contribuído para a união e valorização do território, não só porque a estrada ajuda na perceção de um determinado espaço geográfico, mas também pela forma como os trajetos viários condicionam essa visão/perceção. Neste sentido, à estrada paisagística corresponde uma missão: sensibilização paisagística, que através de meios desenvolvidos em paralelo com esta iniciativa pode resultar numa cultura de educação e respeito pela paisagem e consequentemente pelo local frequentado. Surge, neste contexto, a ideia de organização de uma oferta recreativa de mobilidade de baixa velocidade, isto é, definir e estabelecer uma rede de estradas paisagísticas com o objetivo próprio de entendimento e consequente desfrute do espaço pela sociedade atual, que corresponda a uma metodologia precisa e atualizada. Seguindo de perto a abordagem metodológica usada na vizinha Andaluzia para obtenção de um catálogo de estradas paisagísticas, o objetivo da proposta de catálogo de estradas paisagísticas do Algarve apresentada neste estudo, não é formar uma rede nova de estradas, mas sim valorizar a rede de circulação já existente na região, enriquecendo a com o reconhecimento paisagístico presente, dando uma nova função a traçados viários existentes que preencham os parâmetros predefinidos, de forma a incentivar uma atualização das condições de segurança ao acesso de valores paisagísticos e culturais importantes no reconhecimento do território. O primeiro catálogo de cinco estradas paisagísticas do Algarve aqui apresentado (nos limites Este e Oeste do Algarve, as estradas EM507- Rio Guadiana e EN268 – Costa Vicentina, respetivamente; a Norte, na Serra algarvia, a estrada EN267 – Serra de Monchique, e a Sul, na área do Barrocal, a EN124; englobando as três unidades geomorfológicas do Algarve e atravessando o território algarvio transversalmente, a estrada património EN2), tem como propósito incentivar o reconhecimento da paisagem algarvia por quem utiliza estas estradas. Em conjunto com outras iniciativas, a presente proposta pode ser considerada como um instrumento na intervenção destas infraestruturas, fazendo da estrada uma ferramenta para o conhecimento do próprio território. Os troços viários selecionados estão distribuídos pelas diferentes zonas do território algarvio, expondo a diversidade paisagística presente ao longo da região através de fichas de reconhecimento, onde se enumeram os aspetos técnicos e de desenho, a caracterização paisagística geral e um parâmetro de diagnóstico descritivo dos valores, conflitos, ameaças e sugestões que visam a valorizar o espaço.
- Melhoramento da microalga Nannochloropsis oceanica para produção de compostos de valor acrescentadoPublication . Pina, Maria Alice Mendes de; Varela, João Carlos Serafim; Schüler, Lisa MaylinNas últimas décadas, tem-se assistido, da parte da comunidade científica, a um interesse acrescido no melhoramento da capacidade de produção das microalgas e da extração de compostos com valor acrescido, tendo em vista aplicações no campo farmacêutico e alimentar. Este trabalho centrou-se na obtenção de novas estirpes mutantes de Nannochloropsis oceanica com uma melhorada capacidade para a produção do ácido eicosapentenóico (EPA), um ácido gordo polinsaturado ómega-3 . Para este efeito, são utilizadas habitualmente duas estratégias: fisiológicas ou genéticas. A primeira, utiliza a manipulação dos fatores abióticos, enquanto que na segunda, utiliza-se a mutagénese aleatória, em combinação com inibidores de vias metabólicas (por exemplo, nicotina), para se obterem estirpes mutantes de alto desempenho e capacidade de produção de carotenoides. Neste trabalho, pretendeu-se determinar o melhor meio de cultura e a melhor combinação de fatores abióticos de forma a potenciar um aumento na produtividade de EPA e carotenoides da microalga Nannochloropsis oceanica. Neste trabalho conclui-se que o meio a utilizar como meio de inoculação foi o Meio Algal Modificado (MAM) em relação ao qual a N. oceanica apresentou uma taxa de crescimento de 4,24 células.d-1. Seguidamente, sujeitou-se esta microalga a várias condições de stress abióticos (diferentes concentrações de nutrientes, várias intensidades luminosas e temperaturas). Verificou-se que a espécie N. oceanica exibe uma elevada produtividade para o ácido eicosapentenóico (EPA) quando cultivada a 10x MAM, alcançando 9,43 mg EPA .L-1.d-1, sujeita a uma alta intensidade luminosa foi produzido 9,40 mg EPA .L-1.d-1 e com uma temperatura de 22ºC uma concentração de EPA de 7,36 mg..L-1.d-1. Em relação à produção de carotenoides, o comportamento é inverso, tendose verificado que elevadas intensidades luminosas resultam numa baixa produtividade de EPA. Relativamente à obtenção de mutantes, recorreu-se ao processo de mutagénese aleatória (MA) com metanossulfonato de etilo (EMS) a várias concentrações. Obteve-se crescimento em placa apenas quando utilizada a menor concentração de EMS (250 Mm) com a nicotina como agente inibidor de vias metabólicas. Conclui-se que a para a produção de EPA as melhores condições de cultivo microalgal são uma elevada intensidade luminosa (110 μmol.m2. s-1 ), 22ºC de temperatura com 10x meio MAM. Em relação à produção de carotenoides os melhores resultados foram alcançados com uma intensidade luminosa de 50 μmol.m2. s-1 , 30ºC de temperatura e com 10x meio MAM. Conclui-se ainda que concentrações superiores a 250 μM de EMS são letais para N. oceanica
- Prática e caracterização do jardim residencial enquadrado em empreendimentos turísticos na região centro-litoral do Algarve: estágio profissional na empresa IngreenPublication . Santos, Priscilla da Silva Parreira dos; Monteiro, José António Carreira SaraivaOs jardins residenciais são jardins privados muitas vezes planeados pelos próprios proprietários e que possuem um papel fundamental a nível social e ambiental, aproximando o ser humano da natureza. Esta tipologia de jardins, tem vindo a ganhar elevado destaque no litoral algarvio devido ao crescimento de resorts turísticos associados ao turismo sol-praia-golf, como é o caso da Quinta do Lago e Vale de Lobo. Contudo, a composição destes espaços verdes encontra-se pouco compreendida e estudada. Posto isto, através de análise feita aos projetos desenvolvidos durante o estágio e reunião com o orientar do mesmo, procurou-se perceber quais as razões que levam um proprietário a procurar um técnico para projetar o seu jardim, quais os aspetos mais importantes a integrar num projeto de arquitetura paisagista deste caráter e quais as preferências dos proprietários na organização funcional e escolha de espécies do seu jardim. A análise realizada aos jardins residenciais privados da Quinta do Lago e Vale de lobo demonstrou que existe pouca diversidade relativamente à quantidade de espécies propostas. Na escolha das espécies, os clientes dão preferência a características relacionadas com o aspeto estético e não demonstram preocupação com fatores relacionados com a sustentabilidade, como por exemplo a necessidade hídrica das plantas. O estudo desta tipologia de espaços verdes demonstrou que os clientes preferem espécies exóticas e a áreas com relvado. Muitas vezes a escolha da vegetação ou da tipologia de jardim vai de encontro ao que os clientes vêm nos outros jardins da Quinta do Lago tais como: Sebe a delimitar o lote, zonas de estadia com relva , zona de barbecue junto à piscina e campo de jogos.
- Investigation of natural patterns of coral recruit-benthos interactions with a focus on interactions with crustose coralline algae in Moorea, French PolynesiaPublication . Clément, Esclavy; Vinagre, CatarinaCrustose coralline algae and macroalgae play a vital role in the coral reef ecosystem by engaging in intricate relationships with corals. It is widely recognized that corals and crustose coralline algae (CCA) can form associations that have the potential to be beneficial for both the corals and the entire reef ecosystem. However, these relationships are often intricate and can be challenging to ascertain due to their subtlety. Because of the importance of CCA in coral reefs, there is growing interest in understanding their interactions with corals, in particular at the recruit life stage, although these relationships remain relatively undocumented and require specialist expertise. In the context of this study, we conducted an in-situ survey at two distinct sites on the island of Moorea, namely Rotui and Temae. The objective of this research was to explore the type and outcomes of interactions between coral recruits and algae, with a focus on crustose coralline algae. All non-cryptic CCA species exhibited neutral associations with corals, with predominantly negative outcomes on both study sites. Porolithon onkodes, a CCA, primarily displayed neutral interactions with coral recruits, although a negative percentage was recorded, positioning it as the less favorable CCA in these interactions. Additionally, more negative outcomes were identified for this CCA concerning small recruits (< 5 mm). Cryptic CCAs, in contrast, demonstrated significantly more positive interactions, displaying a substantial quantity of positive associations with coral recruits. This was observed along with positive outcomes with Harveylithon munitum, Mastophora Pacifica, and CCA species CCA species forming thin crusts, with some variations between the two study sites. Algae of the Peyssonnelia genus, the only non-calcareous macroalgae studied, exhibited no detrimental interactions with corals. Instead, they showed a considerable number of positive associations with coral recruits and were highly preferred by recruits under 5 mm. The results of this study reveal the patterns of species-specific associations between CCAs and coral recruits in Moorea, while confirming the conclusions of previous studies on the interactions between corals and macroalgae. This makes it possible to determine which organisms promote successful coral recruitment and to identify those likely to alter the associations between corals and coralline algae, by inhibiting or hindering the recruitment of coral larvae.
- Firecheckin: automatização e gestão de operacionais e veículos num teatro de operaçõesPublication . Alves, José António Bacelar Glória; Oliveira, José Valente deAtualmente, nos incêndios urbanos, os operacionais dos Bombeiros ao entrarem num edifício, usam um dispositivo que é denominado como Alarme Pessoal de Segurança (APS). É um sistema pessoal autónomo de alerta e segurança, que deteta a paragem de movimentos corporais e ativa um alarme automaticamente. Para os incêndios florestais, por experiência própria, também devia ser implementado um sistema de monitorização, localização e orientação de cada operacional, ficando alerta sobre o estado de cada bombeiro, ativando um alerta em determinadas condições. Também é necessário informatizar toda a operacionalização de colocação de veículos e operacionais num combate a incêndios, disponibilizando um mapa numa página web, com os elementos em tempo real.
- Assessing the population size and range dynamics of the atlantic humpback dolphin (Sousa teuszii) in the saloum delta, Senegal, based on two years of photo-identificationPublication . Seck, Diana; Castro, Maria Margarida Miranda de; Keith-Diagne, Lucy W.The Atlantic humpback dolphin (Sousa teuszii), is a critically endangered species found along the coast of West and Central Africa, including the Saloum Delta in Senegal. The presence of the Atlantic humpback dolphin has been confirmed in at least 13 countries along the West African coast. For the remaining six countries, it is unknown whether the lack of data is due to the lack of researchers focusing on the Atlantic humpback dolphin, or whether the species is truly absent from those countries. This study aimed to contribute to our understanding of this species by creating the first long-term photo-identification catalog, Mark-Recapture Analysis, and absolute population abundance estimate in the Saloum Delta, Senegal. The photo identification catalog was established through the collection and analysis of more than 13,000 photographs that captured unique markings and pigmentation patterns on individual dolphins during boat surveys conducted throughout the Saloum Delta in July 2021 and March-April 2022. A total of 164 individual dolphins were identified based on the unique markings on their dorsal fins. Of these 164 (24.4%) were observed on more than one occasion, 9.1% more than two times, and 3.7% more than three times. Mapping of movements of these individuals demonstrated that some ranged widely while others showed high site fidelity. A simple Chapman-modified Petersen mark-recapture estimate generated an abundance estimate of 469 individuals (CV 5733, 95% confidence interval 275 to 801). These preliminary results confirm the results of earlier studies indicating that the Saloum Delta hosts one of the largest known populations of AHD throughout its range and provides additional incentive to conserve the population and its habitat.