Publication
Bacteriobenthos diversity in the surface of different sediment environments in Ria Farmosa
| datacite.subject.fos | Engenharia e Tecnologia::Outras Engenharias e Tecnologias | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Duarte, Duarte | |
| dc.contributor.advisor | Reis, Margarida P. | |
| dc.contributor.author | Vidal, Ana Flor Torres | |
| dc.date.accessioned | 2016-05-12T09:03:21Z | |
| dc.date.available | 2016-05-12T09:03:21Z | |
| dc.date.issued | 2015-09-11 | |
| dc.date.submitted | 2015 | |
| dc.description | Dissertação de Mestrado, Biologia Marinha, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2015 | pt_PT |
| dc.description.abstract | A diversidade pode ser definida como o número e variedade de espécies e a sua relação espacial, numa determinada área. De forma a observar eventuais padrões de diversidade bacteriobentónica associados com as diferentes origens das camadas superficiais de sedimentos de diferentes ambientes, pretendeu-se estudar diferentes conjuntos de ambientes sedimentares localizados nas imediações das barras do sistema lagunar da Ria Formosa, tendo em consideração o hidrodinamismo e a variação temporal e como poderão afectar os diferentes ambientes sedimentares e a sua biologia. Num contexto geral, pretendeu-se analisar a camada superficial de sedimentos, e proceder à extração de DNA das bactérias aderidas, nos diferentes locais. Pretendeu-se assim, avaliar a diversidade bacteriana nestes ambientes, e a forma como poderá estar relacionada com os diferentes ambientes sedimentares. Serão as populações bacterianas as mesmas nos diferentes ambientes, ou existirá um padrão distinto na sua diversidade? De forma a obter a diversidade dos grupos bacterianos de diferentes ambientes sedimentares, na Ria Formosa, procedeu-se à aplicação da técnica de “Nested PCR-DGGE” (electroforese desnaturante de amplicões obtidos em sucessivas reacções de PCR – reacção em cadeia da DNA polimerase). De acordo com a literatura, foram escolhidos fragmentos iniciadores («primer») específicos do 16S cDNA. Após a primeira amplificação, foi efetuada uma segunda com os produtos da anterior, resultando em amplicões mais específicos que foram subsequentemente separados por electroforese em gel desnaturante - DGGE, da qual se obtiveram perfis característicos. A comparação estatística entre os replicados e entre as amostras dos diferentes ambientes sedimentares, produziu informação suficiente para identificar padrões específicos de diversidade bacteriobentónica. | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 201193388 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.1/8218 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | pt_PT |
| dc.subject | Diversidade | pt_PT |
| dc.subject | Bacteriobenthos | pt_PT |
| dc.subject | Ambientes Sedimentares | pt_PT |
| dc.subject | DGGE | pt_PT |
| dc.subject | Ria Formosa | pt_PT |
| dc.title | Bacteriobenthos diversity in the surface of different sediment environments in Ria Farmosa | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | openAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.grantor | Universidade do Algarve. Faculdade de Ciências e Tecnologia | pt_PT |
| thesis.degree.level | Mestre | pt_PT |
| thesis.degree.name | Mestrado em Biologia Marinha | pt_PT |