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- Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolismPublication . Lavecchia, Anna; Fosso, Bruno; Engelen, Aschwin; Borin, Sara; Manzari, Caterina; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Placido, AntonioBackground Macroalgae, especially reds (Rhodophyta Division) and browns (Phaeophyta Division), are known for producing various halogenated compounds. Yet, the reasons underlying their production and the fate of these metabolites remain largely unknown. Some theories suggest their potential antimicrobial activity and involvement in interactions between macroalgae and prokaryotes. However, detailed investigations are currently missing on how the genetic information of prokaryotic communities associated with macroalgae may influence the fate of organohalogenated molecules. Results To address this challenge, we created a specialized dataset containing 161 enzymes, each with a complete enzyme commission number, known to be involved in halogen metabolism. This dataset served as a reference to annotate the corresponding genes encoded in both the metagenomic contigs and 98 metagenome-assembled genomes (MAGs) obtained from the microbiome of 2 red (Sphaerococcus coronopifolius and Asparagopsis taxiformis) and 1 brown (Halopteris scoparia) macroalgae. We detected many dehalogenation-related genes, particularly those with hydrolytic functions, suggesting their potential involvement in the degradation of a wide spectrum of halocarbons and haloaromatic molecules, including anthropogenic compounds. We uncovered an array of degradative gene functions within MAGs, spanning various bacterial orders such as Rhodobacterales, Rhizobiales, Caulobacterales, Geminicoccales, Sphingomonadales, Granulosicoccales, Microtrichales, and Pseudomonadales. Less abundant than degradative functions, we also uncovered genes associated with the biosynthesis of halogenated antimicrobial compounds and metabolites. Conclusion The functional data provided here contribute to understanding the still largely unexplored role of unknown prokaryotes. These findings support the hypothesis that macroalgae function as holobionts, where the metabolism of halogenated compounds might play a role in symbiogenesis and act as a possible defense mechanism against environmental chemical stressors. Furthermore, bacterial groups, previously never connected with organohalogen metabolism, e.g., Caulobacterales, Geminicoccales, Granulosicoccales, and Microtrichales, functionally characterized through MAGs reconstruction, revealed a biotechnologically relevant gene content, useful in synthetic biology, and bioprospecting applications.
- Documentos das provas de agregação de Célia Maria Quitério Ramos. Titulo da Lição: Análise de Sentimento Aplicada à Gestão da Atividade TurísticaPublication . Ramos, CeliaNeste documento apresenta-se o relatório sobre uma unidade curricular, apresentado por Célia Maria Quitério Ramos, para obtenção do título académico de agregado pela Faculdade de Economia da Universidade do Algarve, no ramo das Ciências Económicas e Empresariais e na especialidade de Gestão, nos termos na alínea b) do artigo 9.º do Despacho n.º 2251/2020, de 17 de fevereiro, Regulamento de Atribuição do Título Académico de Agregado da Universidade do Algarve, que define os procedimentos para a obtenção do título académico de agregado a que se refere o Decreto-Lei n.º 239/2007 de 19 de junho. Este seminário insere-se na área científica de Gestão (Sistemas de Informação). Para o efeito, o presente relatório versa sobre a unidade curricular (UC) de Sistemas de Informação II, a qual integra o plano de estudos do curso de Licenciatura em Gestão da Escola Superior de Gestão, Hotelaria e Turismo da Universidade do Algarve. Esta unidade curricular está classificada na área científica de Sistemas e Tecnologias de Informação e, como tal, enquadrada no ramo das Ciências Económicas e Empresariais e na especialidade de Gestão em que as provas de agregação são requeridas.
- Documentos das provas de agregação de Ana Rita Correia de Freitas Castilho da Costa. Titulo da Lição: Marine Biogeography and EvolutionPublication . Castilho, RitaThis document is part of the instruction process for Rita Castilho's candidacy to “Agregação”, under the terms of Decree-Law nº 239/2007 of 19 June, of the Ministry of Science, Technology and Higher Education. It constitutes the pedagogical report of the curricular unit of Evolution and Marine Biogeography and is presented in English because the UC is part of the course plan of the (international) Master's Degree in Marine Biology at the University of Algarve, which is entirely taught in English. This document contains the contents of the program presented in detail and serves as a basis for the lessons of the curricular unit. The lesson is a general review of the Northeastern Atlantic and Mediterranean phylogeography, mainly focused on fish, although other biological models are also referred to when appropriate. We will first build background information before addressing the case studies. As background information, we will refer to (1) the formation of the Atlantic and Mediterranean basins; (2) the significant changes in their conformation, (3) the geological and climatic events and their impacts on marine populations; (4) the main drivers of marine dispersion and differentiation; (5) the genetic assessment of connectivity among populations; (6) the main molecular markers used in phylogeography. With this foundation laid out, we proceed to expose various illustrative case studies that represent examples that follow hypotheses and expectations and others that are exceptions, showing the richness of knowledge that can be derived from phylogeographic studies.
- Documentos das provas de agregação de Dora Lúcia Miguel Agapito. Titulo da Lição: Sensory Consumer Experiences and Well-being in Tourism and Hospitality Management: Opportunities and ChallengesPublication . Agapito, Dora Lúcia MiguelO presente Relatório foi elaborado de acordo com o disposto na alínea b) do artigo 8º do Decreto-Lei nº239/2007, de 19 de junho, onde se estipula que as provas de agregação são constituídas, para além do Curriculum Vitae do candidato e do sumário detalhado de uma lição ou seminário, por um relatório de unidade curricular (ou grupo de unidades curriculares ou ciclo de estudos) a ser apresentado, apreciado e discutido no âmbito do ramo de conhecimento ou especialidade em que são prestadas as provas (Ciências Económicas e Empresariais, Especialidade em Gestão). Para o efeito, o Relatório que se apresenta versa sobre a unidade curricular de Comportamento do Consumidor (Consumer Behaviour), que integra o plano de estudos do Mestrado em Gestão de Organizações Turísticas (Tourism Organizations Management) da Faculdade de Economia da Universidade do Algarve. As áreas científicas deste Mestrado são o Turismo, a Gestão, a Economia e os Métodos Quantitativos. O Curso é lecionado em inglês e está estruturado em dois anos letivos. O primeiro ano (60 ECTS) está organizado em dois semestres dedicados à componente curricular. O segundo ano (60 ECTS) corresponde ao desenvolvimento de uma dissertação, de um projeto ou de um relatório de estágio.
- Documentos das provas de agregação de Guilherme José Fresca Mirador de Andrade Castela. Titulo da Lição: Contribuições dos Métodos de Três-Vias para a Tomada de Decisões na GestãoPublication . Castela, GuilhermeEsta lição foi elaborada de modo a preencher um dos requisitos de admissão a provas de Agregação na Universidade do Algarve, no ramo das Ciências Económicas e Empresariais, especialidade em Gestão, em conformidade com o estabelecido na alínea a) do n.º 2 do artigo 8.º, do Decreto-Lei n.º 239/2007, de 19 de junho. A lição que se apresenta encontra-se estruturada em torno de quatro áreas da gestão onde os processos de tomada de decisões têm por base informações complementares resultantes de métodos de Estatística Multivariada, designadamente: a Gestão Municipal, a Gestão de Unidades de Saúde, a Gestão de Centros Comerciais e a Gestão de Resíduos Urbanos. Com efeito, a Estatística Multivariada é uma área da estatística que se concentra em análises de dados, envolvendo múltiplas variáveis simultaneamente e é frequentemente utilizada no processo da tomada de decisão na gestão, tendo em vista auxiliar o desenvolvimento das funções de Planeamento, de Organização, de Direção e de Controlo. Neste contexto, a importância dos métodos estatísticos de Três-Vias revelam-se particularmente importantes para analisar conjuntos de dados complexos que auxiliam os gestores na tomada de decisões informadas, como por exemplo: compreender as relações entre múltiplas variáveis, identificar padrões e tendências, desenvolver modelos preditivos e promover uma alocação de recursos mais eficiente. (...)