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- Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolismPublication . Lavecchia, Anna; Fosso, Bruno; Engelen, Aschwin; Borin, Sara; Manzari, Caterina; Picardi, Ernesto; Pesole, Graziano; Placido, AntonioBackground Macroalgae, especially reds (Rhodophyta Division) and browns (Phaeophyta Division), are known for producing various halogenated compounds. Yet, the reasons underlying their production and the fate of these metabolites remain largely unknown. Some theories suggest their potential antimicrobial activity and involvement in interactions between macroalgae and prokaryotes. However, detailed investigations are currently missing on how the genetic information of prokaryotic communities associated with macroalgae may influence the fate of organohalogenated molecules. Results To address this challenge, we created a specialized dataset containing 161 enzymes, each with a complete enzyme commission number, known to be involved in halogen metabolism. This dataset served as a reference to annotate the corresponding genes encoded in both the metagenomic contigs and 98 metagenome-assembled genomes (MAGs) obtained from the microbiome of 2 red (Sphaerococcus coronopifolius and Asparagopsis taxiformis) and 1 brown (Halopteris scoparia) macroalgae. We detected many dehalogenation-related genes, particularly those with hydrolytic functions, suggesting their potential involvement in the degradation of a wide spectrum of halocarbons and haloaromatic molecules, including anthropogenic compounds. We uncovered an array of degradative gene functions within MAGs, spanning various bacterial orders such as Rhodobacterales, Rhizobiales, Caulobacterales, Geminicoccales, Sphingomonadales, Granulosicoccales, Microtrichales, and Pseudomonadales. Less abundant than degradative functions, we also uncovered genes associated with the biosynthesis of halogenated antimicrobial compounds and metabolites. Conclusion The functional data provided here contribute to understanding the still largely unexplored role of unknown prokaryotes. These findings support the hypothesis that macroalgae function as holobionts, where the metabolism of halogenated compounds might play a role in symbiogenesis and act as a possible defense mechanism against environmental chemical stressors. Furthermore, bacterial groups, previously never connected with organohalogen metabolism, e.g., Caulobacterales, Geminicoccales, Granulosicoccales, and Microtrichales, functionally characterized through MAGs reconstruction, revealed a biotechnologically relevant gene content, useful in synthetic biology, and bioprospecting applications.
- Documentos das provas de agregação de Célia Maria Quitério Ramos. Titulo da Lição: Análise de Sentimento Aplicada à Gestão da Atividade TurísticaPublication . Ramos, CeliaNeste documento apresenta-se o relatório sobre uma unidade curricular, apresentado por Célia Maria Quitério Ramos, para obtenção do título académico de agregado pela Faculdade de Economia da Universidade do Algarve, no ramo das Ciências Económicas e Empresariais e na especialidade de Gestão, nos termos na alínea b) do artigo 9.º do Despacho n.º 2251/2020, de 17 de fevereiro, Regulamento de Atribuição do Título Académico de Agregado da Universidade do Algarve, que define os procedimentos para a obtenção do título académico de agregado a que se refere o Decreto-Lei n.º 239/2007 de 19 de junho. Este seminário insere-se na área científica de Gestão (Sistemas de Informação). Para o efeito, o presente relatório versa sobre a unidade curricular (UC) de Sistemas de Informação II, a qual integra o plano de estudos do curso de Licenciatura em Gestão da Escola Superior de Gestão, Hotelaria e Turismo da Universidade do Algarve. Esta unidade curricular está classificada na área científica de Sistemas e Tecnologias de Informação e, como tal, enquadrada no ramo das Ciências Económicas e Empresariais e na especialidade de Gestão em que as provas de agregação são requeridas.
- Documentos das provas de agregação de Ana Rita Correia de Freitas Castilho da Costa. Titulo da Lição: Marine Biogeography and EvolutionPublication . Castilho, RitaThis document is part of the instruction process for Rita Castilho's candidacy to “Agregação”, under the terms of Decree-Law nº 239/2007 of 19 June, of the Ministry of Science, Technology and Higher Education. It constitutes the pedagogical report of the curricular unit of Evolution and Marine Biogeography and is presented in English because the UC is part of the course plan of the (international) Master's Degree in Marine Biology at the University of Algarve, which is entirely taught in English. This document contains the contents of the program presented in detail and serves as a basis for the lessons of the curricular unit. The lesson is a general review of the Northeastern Atlantic and Mediterranean phylogeography, mainly focused on fish, although other biological models are also referred to when appropriate. We will first build background information before addressing the case studies. As background information, we will refer to (1) the formation of the Atlantic and Mediterranean basins; (2) the significant changes in their conformation, (3) the geological and climatic events and their impacts on marine populations; (4) the main drivers of marine dispersion and differentiation; (5) the genetic assessment of connectivity among populations; (6) the main molecular markers used in phylogeography. With this foundation laid out, we proceed to expose various illustrative case studies that represent examples that follow hypotheses and expectations and others that are exceptions, showing the richness of knowledge that can be derived from phylogeographic studies.
- Documentos das provas de agregação de Dora Lúcia Miguel Agapito. Titulo da Lição: Sensory Consumer Experiences and Well-being in Tourism and Hospitality Management: Opportunities and ChallengesPublication . Agapito, Dora Lúcia MiguelO presente Relatório foi elaborado de acordo com o disposto na alínea b) do artigo 8º do Decreto-Lei nº239/2007, de 19 de junho, onde se estipula que as provas de agregação são constituídas, para além do Curriculum Vitae do candidato e do sumário detalhado de uma lição ou seminário, por um relatório de unidade curricular (ou grupo de unidades curriculares ou ciclo de estudos) a ser apresentado, apreciado e discutido no âmbito do ramo de conhecimento ou especialidade em que são prestadas as provas (Ciências Económicas e Empresariais, Especialidade em Gestão). Para o efeito, o Relatório que se apresenta versa sobre a unidade curricular de Comportamento do Consumidor (Consumer Behaviour), que integra o plano de estudos do Mestrado em Gestão de Organizações Turísticas (Tourism Organizations Management) da Faculdade de Economia da Universidade do Algarve. As áreas científicas deste Mestrado são o Turismo, a Gestão, a Economia e os Métodos Quantitativos. O Curso é lecionado em inglês e está estruturado em dois anos letivos. O primeiro ano (60 ECTS) está organizado em dois semestres dedicados à componente curricular. O segundo ano (60 ECTS) corresponde ao desenvolvimento de uma dissertação, de um projeto ou de um relatório de estágio.
- Documentos das provas de agregação de Guilherme José Fresca Mirador de Andrade Castela. Titulo da Lição: Contribuições dos Métodos de Três-Vias para a Tomada de Decisões na GestãoPublication . Castela, GuilhermeEsta lição foi elaborada de modo a preencher um dos requisitos de admissão a provas de Agregação na Universidade do Algarve, no ramo das Ciências Económicas e Empresariais, especialidade em Gestão, em conformidade com o estabelecido na alínea a) do n.º 2 do artigo 8.º, do Decreto-Lei n.º 239/2007, de 19 de junho. A lição que se apresenta encontra-se estruturada em torno de quatro áreas da gestão onde os processos de tomada de decisões têm por base informações complementares resultantes de métodos de Estatística Multivariada, designadamente: a Gestão Municipal, a Gestão de Unidades de Saúde, a Gestão de Centros Comerciais e a Gestão de Resíduos Urbanos. Com efeito, a Estatística Multivariada é uma área da estatística que se concentra em análises de dados, envolvendo múltiplas variáveis simultaneamente e é frequentemente utilizada no processo da tomada de decisão na gestão, tendo em vista auxiliar o desenvolvimento das funções de Planeamento, de Organização, de Direção e de Controlo. Neste contexto, a importância dos métodos estatísticos de Três-Vias revelam-se particularmente importantes para analisar conjuntos de dados complexos que auxiliam os gestores na tomada de decisões informadas, como por exemplo: compreender as relações entre múltiplas variáveis, identificar padrões e tendências, desenvolver modelos preditivos e promover uma alocação de recursos mais eficiente. (...)
- Documentos das provas de agregação de Luis Miguel Nunes. Titulo da Lição: Risk ManagementPublication . Nunes, LuísO presente documento constitui o relatório pedagógico da unidade curricular de “Risk Management” (2 ECTS) apresentado no âmbito de Provas Públicas de Agregação na Universidade do Algarve, de acordo com o estabelecido no artigo 5º, alínea b) do Decreto-Lei nº239/2007, de 19 de junho: as provas de agregação são constituídas “pela apresentação, apreciação e discussão de um relatório sobre uma unidade curricular, grupo de unidades curriculares, ou ciclo de estudos, no âmbito do ramo do conhecimento ou especialidade em que são prestadas as provas”. In this subject we will study the general framework for risk management applied to the production, storage, transport, and use of chemical substances, having humans as the target receptors.(...)
- Documentos das provas de agregação de Bruno Mendes da Silva.Titulo da Lição: Disponível para amarPublication . Mendes da Silva, BrunoSumário pormenorizado da lição de síntese apresentada no âmbito das provas de habilitação para o título de Agregado na Especialidade em Comunicação, Cultura e Arte, da Universidade do Algarve, de acordo com a alínea c) do artigo 5.º do Decreto-lei n.º 239/2007, de 19 de junho.“Lição sobre um tema dentro do âmbito do ramo do conhecimento ou especialidade em que são prestadas as provas.” O tema escolhido para esta lição, de acordo com as alíneas c) dos artigos 8.º e 5.º do Decretolei n.º 239/2007, de 19 de junho, é parte constituinte dos conteúdos programáticos Unidade Curricular de Comunicação Audiovisual, do curso de licenciatura em Ciências da Comunicação, da Escola Superior de Educação e Comunicação, da Universidade do Algarve. Embora o nome da Unidade Curricular tenha sofrido alterações, em linha com as restruturações que o curso tem vindo a implementar, os conteúdos programáticos e a sua consequência têm mantido uma lógica operativa e funcional. Ainda assim, a atualização de matérias e de materiais de apoio está explicitada em publicações como The Forking Paths, Interactive Film and Media, de 2021, que aponta para o futuro próximo da linguagem audiovisual, objeto de estudo desta disciplina e, principalmente, em Comunicação Audiovisual: o comboio do amor, publicado no mesmo ano (ambas constantes no documento “Seleção de Publicações”). Esta última obra, assume-se, atualmente, como base teórica da Unidade Curricular de Comunicação Audiovisual. Neste sentido, a lição “Disponível para amar” é parte integrante do livro de apoio à Unidade Curricular e coincidente com o capítulo 2.2. do livro Comunicação Audiovisual: o comboio do amor. Esta lição propõe uma análise do filme Disponível para amar, realizado por Wong Kar-Wai no ano 2000. Esta análise importa aos estudantes da Unidade Curricular de Comunicação Audiovisual como ferramenta de consolidação dos conceitos teóricos apresentados na primeira parte da disciplina e como forma de aperfeiçoamento da leitura do texto audiovisual, nomeadamente nos domínios estéticos, formais e conceptuais. Inicia-se com um breve preâmbulo pela história do cinema de Hong Kong, que pretende contextualizar a obra em análise, mostrando como a cidade, o cinema dessa cidade e a narrativa do filme de entrecruzam e confundem. Recupera e relaciona opções estéticas com temáticas recorrentes no filme: o cinema, a comida, a promiscuidade espacial, as especificidades culturais, a solidão, o desejo, as grades e os vestidos cheongsam. Finalmente, importa referir que são deixadas as notas de rodapé que, no livro Comunicação Audiovisual: o comboio do amor, remetem para os elementos gramáticos audiovisuais (e outros conceitos relevantes), marcados a negrito e que constituem um glossário inicial, com o objetivo de facilitar a consulta rápida por parte dos estudantes.
- Documentos das provas de agregação de Joaquim António Belchior Mourato. Titulo da Lição: Gestão da performancePublication . Mourato, JoaquimPara candidatura ao título académico de agregado pela Universidade do Algarve, nos termos do Decreto-Lei nº 239/2007, de 19 de junho, alterado pelo Decreto-Lei 64/2023, de 31 de julho, e do Regulamento de Atribuição do Título Académico de Agregado da Universidade do Algarve (Despacho n.º 2251/2020, de 17 de fevereiro). Este documento apresenta o relatório da Unidade Curricular (UC) de Gestão da Performance como elemento da candidatura ao título de agregado pela Universidade do Algarve, no ramo do conhecimento de Ciências Económicas e Empresariais, especialidade Gestão, de acordo com o Decreto-Lei nº 239/2007, de 19 de junho, alterado pelo Decreto-Lei 64/2023, de 31 de julho. O referido Decreto-Lei possibilita a apresentação do relatório numa UC, grupo de UC’s ou ciclo de estudos. A minha escolha recaiu sobre a apresentação do relatório de uma UC, embora inicie o relatório por uma abordagem ao ciclo de estudos, adicionando um conjunto de propostas de reestruturação resultante de um processo recentemente desenvolvido, pela particularidade que irei apresentar. A escolha do curso de mestrado em Gestão de PME e da UC de Gestão da Performance deve-se ao facto de ter sido o primeiro ciclo de estudos de mestrado criado e implementado no Instituto Politécnico de Portalegre (IPP), tendo iniciado o seu funcionamento no ano letivo 2008/9, em que tive o privilégio de ter coordenado o processo da sua criação, bem como assegurado a coordenação do curso por vários anos. Também fui o responsável pela lecionação da UC de Gestão da Performance desde o seu início, ano letivo 2008/9. Recentemente, participei num processo de revisão do curso, tendo resultado um conjunto de propostas de alteração, que começam agora a ser implementadas, ainda que faseadamente. Mesmo durante o período em que desempenhei as funções de Presidente do IPP, nunca deixei de lecionar a UC de Gestão da Performance, ainda que em parceria com outro colega. Quando terminei as funções de Presidente, em 2017, voltei a assumir a coordenação do curso. Estes factos dizem bem da minha longa ligação ao curso de Gestão de PME e à UC de Gestão da Performance. O meu interesse pelo controlo de gestão e a avaliação do desempenho das organizações já existia há alguns anos. Desde 2000 que lecionava a UC de Controlo de Gestão no curso de licenciatura em Gestão e desde 2005 que estudava e implementava um sistema de gestão integrado no IPP. Assim, a aposta nesta área científica foi natural e prolongou-se até hoje. O presente relatório reflete muito da minha prática docente nesta UC, desde o primeiro ano letivo em que a mesma foi lecionada (2008/2009), até ao ano letivo de 2021/2022. (...)
- Documentos das provas de agregação de Maria Margarida Cortez Vieira. Titulo da Lição: Embalagem ativa de alimentos numa economia biocircularPublication . Vieira, MargaridaPara apreciação em provas de agregação em Ciências Biotecnológicas de acordo com a alínea iii) do ponto 3 do art. 4º do Regulamento de Atribuição do Título Académico de Agregado da Universidade do Algarve publicado em anexo ao Despacho n.º 2251/2020 ao abrigo do nº 2 do artº 4º do Decreto-Lei nº 239/2007, de 19 de junho 2023. Na escolha do tema desta lição que segundo o regulamento deve ser “dentro do âmbito do ramo do conhecimento ou especialidade em que são prestadas as provas”, foi tido em consideração a dedicação durante toda a minha vida académica a uma área do conhecimento em Ciência dos Alimentos, a Conservação dos Alimentos e em particular à Embalagem de Alimentos Ativa e a ao Desenvolvimento de Novos Materiais de embalagem biodegradáveis. Esta dedicação incluiu por um lado a docência de várias unidades curriculares, e por outro a investigação. Ainda, era imperioso que o tema refletisse a atualidade com grande relevância científica e tecnológica. No início da lição é dada uma explicação fundamentada sobre a razão de se considerar a temática desta lição, muito relevante na conjuntura presente, introduzindo-se primeiro a temática dos problemas ambientais do século XXI e referindo-se depois a evolução do conceito de resíduo de embalagem numa economia linear para um novo conceito de subproduto numa economia bio circular. É então introduzido o conceito de embalagem smart, desenvolvendo-se depois mais conhecimento sobre a embalagem ativa e introduzindo a embalagem de libertação controlada (LC) como uma subdivisão da embalagem ativa (EA). Após ser explicado o fundamento deste tipo de embalagem são enunciados todos os fatores que se deve ter em conta quando se projeta uma embalagem de LC para um alimento específico. De seguida a modelação matemática do processo LC de um composto ativo (CA) da embalagem para a superfície do alimento é explicada. A aula termina com uma apresentação do trabalho que tem vindo a ser desenvolvido pelo grupo de investigadores que trabalham na área de embalagem ativa no Departamento de Engenharia Alimentar do ISE/UAlg.
- Documentos das provas de agregação de Vítor Hugo Mendes da Costa Carvalho. Titulo da Lição: Teoria de Sistemas e ControloPublication . Carvalho, VítorO presente documento constitui o cumprimento de um dos requisitos exigidos aos candidatos à realização de provas de agregação. De acordo com o texto legal, as provas de agregação são constituídas “(…) Pela apresentação, apreciação e discussão de um relatório sobre uma unidade curricular, (…), no âmbito do ramo de conhecimento ou especialidade em que são prestadas as provas.”, alínea b) do artigo 5 º - Provas de Agregação, Decreto-Lei nº 239/2007 de 19 de junho de 2007. Este relatório consiste na elaboração do programa para a unidade curricular de Teoria de Sistemas e Controlo lecionada no 2º ano do 1º semestre do curso de Licenciatura em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores do Instituto Politécnico do Cávado e do Ave (IPCA). Apresenta-se a motivação para a escolha desta unidade curricular, bem como o seu enquadramento no curso. Descrevem-se os métodos e técnicas pedagógicas de ensino/aprendizagem que têm sido seguidos pelo autor. Enunciam-se os principais conceitos, bem como a evolução e desafios futuros da área de teoria de sistemas e controlo. Descreve-se a unidade curricular em detalhe, desde os objetivos, conteúdos programáticos, estratégias de funcionamento das aulas, documentação de apoio, métodos de avaliação, resultados de avaliação dos estudantes, bem como os métodos de aferição de qualidade da unidade curricular utilizados no IPCA, entre outros. É também apresentado o novo programa da unidade curricular, iniciado no presente ano letivo 2022/2023. Na redação deste relatório foi considerada a Declaração de Bolonha, modelo de ensino aprendizagem que provocou uma alteração significativa no paradigma de formação bem como na metodologia de ensino e organização curricular dos cursos. As alterações introduzidas pela Lei de Bases do Sistema Educativo relativas à abordagem do modelo de Bolonha, de organização do ensino superior, regulamentadas no Decreto-Lei n. 74/2006 de 24 de março, no que respeita aos ciclos de estudos, referem na sua nota introdutória que a: “Questão central no Processo de Bolonha é o da mudança do paradigma de ensino de um modelo passivo, baseado na aquisição de conhecimentos, para um modelo baseado no desenvolvimento de competências, onde se incluem quer as de natureza genérica - instrumentais, interpessoais e sistémicas - quer as de natureza específica associadas à área de formação, e onde a componente experimental e de projeto desempenham um papel importante.”