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Simonsenia aveniformis sp nov (Bacillariophyceae), molecular phylogeny and systematics of the genus, and a new type of canal raphe system

Publication . Witkowski, Andrzej; Gomes, Ana; Mann, David G.; Trobajo, Rosa; Li, Chunlian; Barka, Frederik; Gusev, Evgeniy; Dabek, Przemyslaw; Grzonka, Justyna; Kurzydlowski, Krzysztof J.; Zglobicka, Izabela; Harrison, Michael; Boski, T.

The genus Simonsenia is reviewed and S. aveniformis described as new for science by light and electron microscopy. The new species originated from estuarine environments in southern Iberia (Atlantic coast) and was isolated into culture. In LM, Simonsenia resembles Nitzschia, with bridges (fibulae) beneath the raphe, which is marginal. It is only electron microscope (EM) examination that reveals the true structure of the raphe system, which consists of a raphe canal raised on a keel (wing), supported by rib like braces (fenestral bars) and tube-like portulae; between the portulae the keel is perforated by open windows (fenestrae). Based on the presence of portulae and a fenestrated keel, Simonsenia has been proposed to be intermediate between Bacillariaceae and Surirellaceae. However, an rbcL phylogeny revealed that Simonsenia belongs firmly in the Bacillariaceae, with which it shares a similar chloroplast arrangement, rather than in the Surirellaceae. Lack of homology between the surirelloid and simonsenioid keels is reflected in subtle differences in the morphology and ontogeny of the portulae and fenestrae. The diversity of Simonsenia has probably been underestimated, particularly in the marine environment.

2015-11Journal article

Open Access

Alterações ambientais na costa algarvia durante o holocénico: um estudo com base em diatomáceas

Publication . Gomes, Ana Isabel de Sousa Horta Dias; Boski, T.; Moura, Delminda; Szkornik, Katie; Witkowski, Andrzej

A sensibilidade das diatomáceas às alterações físico-químicas do meio aquático em que vivem, torna estas algas unicelulares indicadores paleoambientais de alto potencial interpretativo. O presente estudo caracteriza as condições de vida das diatomáceas em zonas de transição oceano-continente do Algarve e assim cria um análogo modeno para interpretações paleoambientais do registo sedimentar. A investigação descrita abrangeu os sedimentos superficiais, a água superficial dos estuários de rios Arade e Guadiana e as diatomáceas associadas aos sedimentos. Tal permitiu: (i) definir associações de diatomáceas e, complementarmente, a concentração dos estomatocistos de crisofíceas ao longo das zonas intermareais dos dois estuários e, (ii) concluir que os parâmetros ambientais que condicionam a distribuição das diatomáceas nestes estuários são principalmente a textura do sedimento, o tempo de inundação e a salinidade da água intersticial do sedimento. Além disso, o fraco gradiente de salinidade observado no estuário do Arade permitiu aprofundar o conhecimento das associações presentes em ambientes de água salobra, enquanto que a análise da distribuição das associações de diatomáceas no estuário do Guadiana contribuiu para aumentar o conhecimento adquirido no estuário do Arade, relacionando a composição das associações com o gradiente completo de salinidade entre o meio marinho e fluvial. Adicionalmente, verificou-se que em ambos os estuários existem espécies que não foram descritas até ao momento. Assim, foi ainda identificado e proposto formalmente um novo género e espécie de diatomácea, a Syvertsenia iberica. A aplicação dos conhecimentos adquiridos no presente trabalho à interpretação dos paleoambientes sedimentares do Plistocénico terminal e Holocénico, nos estuários do Arade e Guadiana, através do desenvolvimento de funções de transferência e do estudo do registo fóssil das diatomáceas e dos estomatocistos de crisofíceas, resultou numa reconstrução mais pormenorizada da evolução das referidas zonas estuarinas, em função da subida do nível médio do mar após o Último Máximo Glacial.

2014-11-03Doctoral thesis

Open Access

Habitats of the Guadiana River estuary

Publication . Gomes, Ana; Camacho, Sarita

The Guadiana River estuary is the most important estuarine system in southern Portugal. The estuary’s variety of habitats supports a great diversity of species. Some of these species have only recently been discovered and are found nowhere else on Earth. This chapter details the current state of knowledge of the estuary’s habitats, with a particular focus on the unseen microscopic flora and fauna that support the entire food chain – and many economic activities – in the estuary.

2017-08Book part

Open Access

Diatomáceas como potencial ferramenta para reconstituições paleoecológicas

Publication . Gomes, A.I.; Boski, T.; Moura, Delminda

As diatomáceas são algas unicelulares que abundam tanto em águas doces como salgadas. Este trabalho mostra que as associações de diatomáceas presentes ao longo de um perfil de sapal, junto à foz do rio Guadiana, são sensíveis a vários parâmetros ambientais. Desta forma, confirma‑se o seu potencial como indicador para reconstruções paleoecológicas em estuários, especialmente no que diz respeito a variações do nível médio do mar, como as ocorridas desde a última transgressão posglacial.

2012Book part

Open Access