Publication
Molecular exploration of bacterial communities associated with azooxanthellate gorgonians in the coast of Algarve, south Portugal
| datacite.subject.fos | Ciências Naturais::Outras Ciências Naturais | pt_PT |
| dc.contributor.advisor | Serrão, Ester | |
| dc.contributor.advisor | Engelen, Aschwin | |
| dc.contributor.advisor | Costa, Rodrigo | |
| dc.contributor.author | Cúcio, Ana Catarina Bernardino | |
| dc.date.accessioned | 2018-09-19T15:29:31Z | |
| dc.date.available | 2018-09-19T15:29:31Z | |
| dc.date.issued | 2012 | |
| dc.date.submitted | 2011 | |
| dc.description.abstract | O presente trabalho avaliou as associações bacterianas entre três espécies de gorgónias (Eunicella verrucosa, E. gazella e Leptogorgia sarmentosa) relativamente ao seu perfil comunitário, diversidade, abundância e identificação filogenética de isolados seleccionados, e estabeleceu comparações entre os referidos perfis e as comunidades bacterianas presentes no meio circundante (isto é, água e sedimento). As associações microbianas entre tecidos saudáveis e doentes de E. verrucosa foram também comparadas utilizando os mesmos parâmetros. O perfil comunitário bacteriano foi realizado com a técnica Gel de Electroforese de Gradiente Desnaturante (DGGE) e revelou associações distintas entre as gorgónias e as amostras ambientais. As amostras de E. verrucosa doentes juntamente com água e sedimento representaram as associações mais diversas. Foi detectada uma especificidade no perfil bacteriano comunitário entre as três espécies estudadas, que revelou ser distinta nos tecidos necróticos. A quantificação bacteriana foi efectuada através de microscopia de epifluorescência e de plaqueamento. Os tecidos doentes de E. verrucosa apresentaram a maior contagem bacteriana tanto por epifluorescência como por plaqueamento [3.99x1010 cél/ml (Número Total de Células – NTC) e 1.8x106 UFC/ml (Unidades Formadoras de Colónias), respectivamente], seguidos pelas amostras de tecidos saudáveis da mesma espécie (2.29x1010 cél/ml e 3.5x105 UFC/ml, respectivamente). Os resultados obtidos das contagens por epifluorescência de E. gazella foram na ordem das 2.09x1010 cél/ml e via plaqueamento na ordem das 2.3x105 UFC/ml, enquanto que para L. sarmentosa foram de 2.42x1010 cél/ml e 1.3x105 UFC/ml, respectivamente. Foram encontradas diferenças significativas nas contagens de plaqueamento entre todas as amostras excepto entre as amostras de E. gazella e L. sarmentosa, e L. sarmentosa e água, e nas contagens por epifluorescência as diferenças significativas observadas foram entre água e todas as gorgónias (p<0.05), segundo o teste estatístico Mann-Whitney. Foram efectuadas análises filogenéticas a partir de isolados seleccionados utilizando o método de Máxima Verosimilhança com o modelo de substituição GTR+G+I. As culturas de tecidos de E. verrucosa revelaram a dominância de membros da classe Gammaproteobacteria (Vibrio sp., Pseudoalteromonas sp. e Shewanella sp., tendo sido os últimos dois géneros detectados apenas em tecidos doentes), embora também tenha sido determinada a presença de membros das classes Alphaproteobacteria (Ruegeria sp.) e Actinobacteria (Micrococcus sp.). O estudo presente identificou perfis comunitários bacterianos específicos entre as espécies estudadas, que diferem do ambiente circundante tanto em diversidade como abundância. Identificou também diferenças entre a diversidade comunitária bacteriana, estrutura e abundância em tecidos doentes e saudáveis de Eunicella verrucosa. | pt_PT |
| dc.identifier.tid | 202201767 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.1/10836 | |
| dc.language.iso | eng | pt_PT |
| dc.subject | Gorgónias azooxateladas | pt_PT |
| dc.subject | Associações coral-bactéria | pt_PT |
| dc.subject | DGGE | pt_PT |
| dc.subject | Doenças de corais | pt_PT |
| dc.subject | Comunidades bacterianas | pt_PT |
| dc.subject | Bactérias marinhas | pt_PT |
| dc.subject | Holobionte coralino | pt_PT |
| dc.title | Molecular exploration of bacterial communities associated with azooxanthellate gorgonians in the coast of Algarve, south Portugal | pt_PT |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| rcaap.rights | restrictedAccess | pt_PT |
| rcaap.type | masterThesis | pt_PT |
| thesis.degree.grantor | Universidade do Algarve. Faculdade de Ciências e Tecnologia | |
| thesis.degree.level | Mestre | |
| thesis.degree.name | Mestrado em Biologia Marinha | pt_PT |