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FCB1-Teses

URI permanente para esta coleção:

http://hdl.handle.net/10400.1/9942

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Percorrer FCB1-Teses por Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS) "10:Reduzir as Desigualdades"

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  • Genetic diversity of rotavirus A causing diarrhea in patients admitted to the Clinic University Hospital in Valencia, Spain (2022-2024)
    Publication . Conjo, Carolina da Glória Dinis; Ferreira, Bibiana I.; Gomez, Javier Buesa; Deus, Nilsa de
    A diarreia é uma das principais causas de mortalidade infantil em todo o mundo, e o rotavírus destaca-se como o principal agente etiológico associado. Neste contexto, muitos países introduziram a vacina contra o rotavírus no seu calendário de vacinação infantil, incluindo a Espanha. No entanto, a carga das doenças diarreicas continua elevada. Existe uma lacuna de informação em relação a infecção por rotavírus em pacientes que não tenham idade pediátrica e muitos fatores podem estar implicados na suscetibilidade a infeção por rotavírus entre eles os fatores genéticos do hospedeiro denominados Histo Blood Group Antigens (HBGA´s), que podem reconhecer agentes entéricos que modulam doenças entéricas infecciosas, conferindo risco ou suscetibilidade à população. Foi realizada uma análise transversal de dados de base hospitalar, de abril de 2022 a fevereiro de 2024, em 136 pacientes atendidos com diarreia no Hospital Clínico Universitário de Valência. A triagem inicial das amostras foi feita por Real-Time PCR no Hospital Clínico Universitário de Valencia, 136 amostras foram positivas para Rotavírus A (RVA) e testadas por RT-PCR para a identificação do genótipo no laboratório de Microbiologia da Universidade de Valência. A maior diversidade de estirpes de rotavírus foi encontrada em crianças menores de 2 anos e os genótipos mais comuns nesta faixa etária foram G4P[8] e G12P[8]. Cerca de 26,5% das amostras eram não tipificáveis, 16,9% correspondiam a G4P[8], 16,2% eram NTP[8] e 11,8% eram G12P[8]. A sazonalidade foi associada à distribuição das estirpes de rotavírus (p-valor<0,001), com maior pico de infecção em maio, julho e abril de 2023. O status secretor do gene FUT2 foi determinado em 7,7% (2/26) das amostras testadas. A presente análise mostrou uma alta proporção de infecção e diversidade genotípica em crianças com menos de 24 meses de idade. No futuro, será necessário investigar a diversidade genética e a dinâmica evolutiva das estirpes de rotavírus. Embora o estudo tenha encontrado dificuldades na determinação do status secretor para FUT2 a partir das amostras fecais, apresentou informações inovadoras sobre o potencial e as limitações desta abordagem.
    2024-09-27Dissertação de mestrado Acesso embargado Ver mais
  • Molecular tools to study SCA2: from new advanced disease models to CRISPR-mediated editing approaches
    Publication . Gonçalves, Rebekah Cavaco Koppenol; Nóbrega, Clévio; Matos, Carlos A.; Almeida, Luís Pereira de
    Spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2) is a rare neurodegenerative disease caused by an abnormal expansion of the trinucleotide CAG in the coding region of ATXN2. This overexpanded CAG region is translated into an abnormally long tract of glutamines within the ATXN2 protein, which above 32 repetitions drives pathology. SCA2 comprehends a complex network of pathological mechanisms, progressively leading to neuronal dysfunction and cell death. As a result of the expanded ATXN2-mediated neurodegeneration, especially affecting the cerebellum and the brainstem, SCA2 patients suffer from several motor and non-motor signs and symptoms, with ataxia as the most frequent. Currently, there is no therapy capable of delaying or stopping disease progression, leading to the premature death of patients. Disease models have proven to be a valuable tool for the study of the pathological mechanisms underlying SCA2. In this work we develop a new transgenic mouse model for SCA2 with early motor and neuropathologic phenotype to study the role of the ATXN2 expanded protein in the pathogenesis of the disease. Additionally, we generated a SCA2 patient-derived iPSC line to serve as a platform to test new advanced therapeutic strategies. Taking advantage of the CRISPR toolbox to manipulate gene expression, we designed three CRISPRbased strategies targeting the ATXN2 gene: a CRISPR-Cas9 indel directing the nuclease activity of Cas9 to an early site of the ATXN2 gene; a CRISPRi using the dCas9-KRAB complex to hinder transcription; and a CRISPR-Cas9 excision directing Cas9 to two sites of the ATXN2 to excise the CAG region. We tested these strategies in the newly generated SCA2 patient-derived iPSC line, inducing its differentiation into mature neurons. The CRISPR strategies resulted in a decrease of the ATXN2 protein levels or the complete ablation of ATXN2 expression, preventing several pathological traits of SCA2. The tools developed in this project support the development of CRISPR-based disease-modifying strategies for SCA2, enlightening the action of ATXN2-mediated pathogenesis.
    2024Tese de doutoramento Acesso embargado Ver mais