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- Remote sensing analysis of recent coastal change and its controlling factors in Darnley Bay (Amundsen Gulf, Canada)Publication . Tanguy, Rodrigue Raymond Phoebus; Delgado, Prates, Gonçalo NunoAs the Arctic warms, permafrost coasts are experiencing higher rates of erosion, threatening coastal communities and infrastructure, and altering sediment and nutrient budgets. However, some areas are still neglected by research. The mouth of the Gulf of Amundsen is home to Darnley Bay, while the coast of the ecologically important Cape Parry to Paulatuk area included in the Anguniaqvia Niqiqyuam Marine Protected Area has been still little studied. This area is home to Arctic char, cod, beluga whales, ringed and bearded seals, polar bears and sea birds. It is also an important area for the Inuvialuit who have an intrinsic attachment to their land ensuring the survival of their culture and food source. Settled in Paulatuk, Inuvialuit are witnessing the warming of their territory and the degradation of the permafrost. This study aims to establish the geomorphological characterization of the Paulatuk coast and peninsula and to quantify coastal changes over 55 years, using a new very high resolution survey based on CNES Pleiades imagery from August 2020, as well as historical aerial imagery from 1965. Key areas, such as Paulatuk, were also surveyed using unmanned aerial vehicles in 2019. The results indicate a small average erosion rate of -0.1 m/year of the surveyed coastlines from 1965 to 2020. At a regional scale, there is a disparity in erosion rates depending on the type of substrate. Erosion rates are significantly different in function of the type of coastal material. Unconsolidated areas show erosion rates of up to -3 m/year while consolidated express stability. These values are relatively low compared to other sites on the Beaufort Sea Coast (e.g. Qikiqtaryuk/Herschel Island, Yukon coast, Mackenzie delta), which are more susceptible to erosion due to soil composition, ground ice content, cliff height and exposure to swells. The very high resolution geomorphological mapping provide important spatial information to the coastal community. Paulatuk is showing signs of degrading permafrost landscape with subsidence zones and potential thaw ponds drainage. A preliminary assessment suggest that infrastructure construction influences permafrost degradation and that future soil thawing process could become a threat for the community. This study, based on unprecedented very high resolution data contributes to the general characterization and identification of erosion rates of the Arctic coasts.
- Monitorização da efetividade e da segurança da terapêutica farmacológica do VIH/SIDA baseada na evidência farmacogenómica: revisão sistemática da literaturaPublication . Santos, Patrícia Sofia Marques dos; Advinha, Ana Margarida Molhinho; Silva, Isabel Maria Júlio daIntrodução: A recente história do VIH (Vírus da Imunodeficiência Humana) afeta todo o mundo e representa uma das principais preocupações de saúde pública da OMS (Organização Mundial de Saúde). Apesar de complexo, o mecanismo de infeção é, atualmente, melhor conhecido, tendo-se conseguido desenvolver fármacos, com distintos locais de atuação no ciclo replicativo do vírus. Desta forma, o tratamento da infeção, ainda que não curativo, conta com múltiplas alternativas, visando regredir a progressão do vírus pelo organismo. Este tratamento leva, regularmente, à ocorrência de efeitos adversos ou falta de efetividade, culminando na não adesão à terapêutica, por parte dos doentes, ou até mesmo em toxicidade, antes de se alcançar a supressão virológica. Para isso, é fundamental garantir a efetividade e a segurança da terapêutica antirretroviral, individualmente, podendo isso ser efetuado a partir da identificação de biomarcadores farmacogenómicos que permitam prever a resposta ao fármaco, prevenindo tanto a ocorrência dos efeitos indesejados como a falta de efetividade. Método: O projeto dividiu-se em duas parte: i) atualização da base de dados com os biomarcadores farmacogenómicos identificados nos RCM (Resumo das Caraterísiticas do Medicamento) de antirretrovirais com AIM (Autorização de Introdução no Mercado) em Portugal; e ii) a elaboração de uma RSL (Revisão Sistemática da Literatura), com base nos dados obtidos da primeira fase, onde se objetivava identificar estudos que identificassem e descrevessem os biomarcadores encontrados nos RCM e outros potencialmente relevantes. Resultados: A maioria dos fármacos com AIM em Portugal continha, no seu RCM, informação farmacogenómica. O biomarcador mais vezes identificado, em RCM, foi o CYP3A (não especificado), contrariamente ao observado na literatura, onde se identificou o CYP2B6 como o biomarcador mais prevalente. A RSL revelou, ainda, a existência de outros biomarcadores relevantes, especialmente no caso do tenofovir. Conclusão: A maior parte das variantes necessita, ainda, de alguma investigação clínica, sendo que apenas um pequeno número é considerada aquando da prescrição destes fármacos. Além disso, a genotipagem não é uma prática comum, sendo necessário maiores incentivos e investimentos nesta área.
- O cumprimento fiscal dos contribuintes individuais em Portugal à luz da teoria do comportamento planeado: um modelo preditivo com equações estruturaisPublication . Alves, Filomena Isabel Gertrudes; Rebelo, Efigénio; Valle, Patrícia Oom doO cumprimento fiscal é uma questão comportamental complexa, e identificar os fatores que influenciam os indivíduos em matéria de cumprimento das suas obrigações fiscais é um desafio, não só para académicos, mas também para decisores políticos e administrações fiscais. Embora os primeiros estudos tenham enfatizado que o cumprimento das obrigações fiscais advinha exclusivamente das consequências económicas da deteção dos incumprimentos e da punição por essa conduta, num passado mais recente, a abordagem comportamental, assente sobretudo nas crenças e nas atitudes dos contribuintes, tem vindo a prevalecer sobre os denominados modelos económicos. Embora não haja como negar o papel das sanções legais na gestão do cumprimento das obrigações fiscais, mas reconhecendo que existem outros fatores igualmente importantes, esta tese visou analisar empiricamente o impacto exercido por um conjunto de variáveis económicas e não económicas no comportamento de cumprimento fiscal dos contribuintes individuais em Portugal à luz da Teoria do Comportamento Planeado, uma das teorias de psicologia social mais utilizadas na previsão do comportamento humano. Foi utilizada uma abordagem quantitativa para testar 15 hipóteses de investigação, tendo os dados sido recolhidos através de um questionário online. Com uma amostra não probabilística constituída por 194 contribuintes individuais em Portugal, foi utilizada a abordagem PLS-SEM (Modelo de Equações Estruturais de Mínimos Quadrados Parciais) para verificar a validade e fiabilidade dos construtos em análise e testar as relações formuladas entre estes. Os resultados validaram a intenção de cumprimento e o controlo comportamental percecionado como preditores do cumprimento fiscal, mas também suportaram que, por muito forte que seja a intenção de cumprir as regras fiscais, o cumprimento é particularmente determinado pela perceção individual da existência de barreiras impeditivas ao incumprimento fiscal. Reforçaram ainda, não só o papel das sanções não legais (ou moral tributária) na formação das atitudes dos contribuintes, mas também que a perceção de justiça acerca do sistema fiscal e da atuação da Autoridade Tributária e Aduaneira contribuiu significativamente para um aumento dessa moral tributária.
- Efeitos terapêuticos e não terapêuticos de Cannabis sativa L.Publication . Gomes, Catarina Cabral; Miguel, Maria GraçaA espécie Cannabis sativa L., também conhecida por cânhamo-indiano, pertence à família Cannabaceae. Desta planta extraem-se diversos compostos, nomeadamente os canabinóides, sendo estes os responsáveis pela maioria das atividades biológicas desta espécie. Os efeitos biológicos dos canabinóides ocorrem através da ativação de recetores mediados pelo sistema endocanabinóide. Para além de aplicações terapêuticas, o cânhamo-indiano também é muito usado em indústrias de construção e isolamento e tem vindo a mostrar cada vez mais valor na indústria alimentar e cosmética. O presente trabalho foca-se nas atividades biológicas dos diversos canabinóides, bem como, nas suas aplicações terapêuticas em algumas patologias tais como, cancro, dor, epilepsia e doenças neurodegenerativas. Para além do mencionado, irá ainda abordar um pouco da história, botânica e métodos de secagem e extração de cânhamo india
- Unveiling the role of cis-regulatory variation in breast cancer aetiologyPublication . Ribeiros, Filipa Alexsandra Oleiro Esteves; Maia, Ana TeresaIn 2020 female breast cancer moved from second to the most commonly diagnosed cancer worldwide. Although an estimated 30% of breast cancer cases are heritable or due to underlying genetic factors, approximately half of the familial risk for breast cancer still remains unknown. Since 2007, continuous efforts from genome-wide association studies (GWAS) and the Collaborative Oncological Gene-Environment Study (COGS) identified low-risk loci that explain up to 18% of the familial relative risk. But, most of the risk-associated variants identified by GWAS are not the true causal variants, and therefore, functional variants and the biological mechanisms underlying breast cancer susceptibility remain largely unknown. Since most of the variants identified by GWAS lie on non-coding genomic regions, risk-associated variants likely have a cis-regulatory function, as shown by several post-GWAS studies focusing on the identification of the causal variants. In this context, the main goal of this project was to develop and use a new and efficient approach to detect target genes and causal variants in known and new breast cancer predisposition loci. Firstly, to address the aforementioned challenges, this work intended to Identify causal variants acting in candidate loci with strong cis-regulatory potential and association with published and unpublished GWAS. Allelic expression (AE) ratios were used as a quantitative variable in case control association studies to understand how genetic variation can control gene expression and to identify cis-regulatory variants and their target genes. For the 17q22 locus two potential regulatory variants – rs17817901 and rs8066588 – altering a miRNA and a transcription factor binding site, respectively, were identified. Additionally, results showed that STXBP4 and COX11 are the most likely target genes in this locus. A significant association was found in normal breast tissue between the preferential expression of the reference alleles of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) located on the 17q22 locus – rs17817901 (TOM1L1/COX11) and rs2628315 (STXBP4) –, and increased risk for breast cancer. This association was also observed in blood samples, which shows the possibility of using this approach in the screening of the general population for breast cancer risk. These results showed that integrating AE ratios as a quantitative variable in case-control association studies is a powerful approach to identify novel risk loci. Next, to perform a genome-wide AE analysis from RNA-sequencing (RNA-seq) data, a comprehensive comparison of variant calling pipelines was conducted. Forty-two variant calling pipelines were systematically compared using data from a gold standard and a normal breast tissue sample. This allowed establishing the most suitable analysis pipeline for further studies aiming at precise AE quantification using RNA-seq data. Finally, this work aimed to identify new loci associated with breast cancer risk, using a genome wide approach. RNA-seq data from 12 normal breast tissue samples of healthy women (controls) and 14 breast cancer patients (cases) was analysed and AE ratios were calculated genome-wide across 7,054 genetic variants. Eight candidate variants associated with breast cancer risk were identified, and for those, the previously proposed case-control association analysis using AE ratios was conducted. This identified CDC16 as the strongest candidate new locus associated with breast cancer risk, with a predicted effect size of -1.83 [95% CI=-2.38, -1.14]. Results from this work provide further evidence that cis-regulatory variation plays a major role in breast cancer susceptibility and shows the power of integrating allelic expression data in cancer risk studies, particularly in identifying risk causal variants and their target genes. Furthermore, it presents a novel efficient approach to identify risk – case-control association analysis using AE ratios. Overall, besides providing important new knowledge on the biological mechanism underlying the risk of breast cancer, which will improve the identification and management of the population at risk, it also provides concepts and approaches that are applicable to other cancers and complex diseases
- Perceção do bem-estar no trabalho: estudo de caso na Junta da Freguesia da GuiaPublication . Bentes, Alexandre Miguel Silva; Contreiras, JoaquimO presente trabalho final do mestrado passará por dois objetivos, sendo que o primeiro está ligado com o desenvolvimento de competências ligadas às tarefas de recursos humanos na instituição autárquica, Junta de Freguesia da Guia. E o segundo objetivo pretende o desenvolvimento de um projeto de investigação relacionado com a percepção do bem-estar no trabalho, na mesma instituição. As práticas e as várias atividades desenvolvidas, assim como o desenvolvimento do projeto de investigação, decorreram em simultâneo. A realização do projeto de investigação teve como objetivo determinar a perceção do bem-estar na instituição onde decorreu o estágio, e para isso, foi realizado um estudo para encontrar os pontos fortes e reforça-los. Desta forma, foi necessária a realização de uma revisão de literatura, onde foram analisados temas como a gestão de recursos humanos, gestão de recursos humanos na administração pública, bem-estar e bem-estar no trabalho. Após abordagem teórica, pretendeu-se responder aos objetivos propostos, através de uma metodologia de intervenção apreciativa e qualitativa, apoiada pela técnica do grupo focal. Foram realizados dois grupos focais com os colaboradores das carreiras de Assistentes Operacionais e Assistentes Técnicos e, de seguida, procedeu-se à analise de conteúdo, enquadrando as respostas dos colaboradores nas categorias e condições do bem-estar. Os excertos retirados das respostas dos colaboradores, servirão para a análise de acordo com os procedimentos/objetivos.
- Conceções dos docentes de uma equipa local de intervenção face à inclusão de crianças com necessidades educativas específicasPublication . Azevedo, Otília Isabel Nunes Mendes Pearce de; Luísa, Cláudia Cristina GuerreiroA inclusão é uma temática muito debatida atualmente e de extrema importância em contexto escolar. Tendo sido alterada recentemente a legislação neste capítulo e, sabendo que a inclusão de todas as crianças no seu grupo de pares é fundamental para que haja um desenvolvimento harmonioso, impõe-se perceber quais são as conceções dos educadores de infância na sua prática e perceber qual o contributo dos docentes de uma equipa local de intervenção (ELI) na inclusão das crianças com Necessidades Educativas Específicas (NEE). Este trabalho tem como objetivo geral contribuir para um maior conhecimento sobre as práticas, implementadas pelos docentes de uma ELI, para a inclusão de crianças com necessidades específicas, numa sala de atividades, em creche e/ou jardim de infância. É uma investigação qualitativa e descritiva, com recurso a entrevistas semiestruturadas, onde através de um conjunto de questões se analisam as perceções de três educadores titulares de grupo, três docentes da Equipa Local de Intervenção de Lagos (ELI - Lagos) e três encarregados de educação, no concelho de Lagos. Concluímos que a inclusão de alunos com NEE é muito importante, pois proporciona benefícios ao nível da autonomia e funcionalidade, ajuda na definição de objetivos e na orientação para uma vida ativa e ajuda a que as crianças com NEE sejam aceites e incluídas na sociedade. Como estratégias de intervenção destacou-se o trabalho cooperativo, pois favorece a interação entre as crianças e desenvolve competências sociais, diversidade das tarefas e dos materiais, parcerias pedagógicas e envolvimento familiar e social.
- Desfiliação religiosa e abuso psicológico em grupo nas Testemunhas de JeováPublication . Ramos, Alexandre José Carvalho; Faísca, LuísProcurámos com esta tese contribuir para o conhecimento referente à desfiliação das Testemunhas de Jeová, e acerca da perceção de abuso psicológico cometido no seio deste grupo religioso. Realizámos em primeiro lugar uma revisão sistemática, com o objetivo de determinar a prevalência da perceção de abuso psicológico em grupo em ex-membros de seitas e cultos. Foram incluídos nesta revisão sistemática artigos publicados em língua inglesa e espanhola. Foi realizada uma busca sistemática da literatura em dez bases de dados eletrónicas para publicações anteriores a 2020. Foram encontrados apenas dois estudos, que reportaram uma elevada prevalência da perceção de abuso psicológico em grupo em ex-membros de seitas e cultos (M = 88.0%). Foram discutidas diversas limitações desta revisão sistemática. Depois, realizámos três estudos empíricos. O primeiro destes estudos teve como objetivos: a) identificar os motivos que levaram indivíduos de Portugal e do Brasil a desfiliarem-se das Testemunhas de Jeová; b) descobrir quais foram as consequências da desfiliação religiosa na vida dessas pessoas; c) explorar associações entre esses motivos e consequências da desfiliação religiosa; d) explorar associações entre a sensação de pertencer às Testemunhas de Jeová quando era membro e os motivos para a desfiliação; e e) avaliar o nível de depressão dos participantes e estudar a possibilidade da depressão ser uma consequência da desfiliação das Testemunhas de Jeová. A amostra foi constituída por 236 ex-Testemunhas de Jeová adultos de ambos os sexos (faixa etária: 16–66 anos), sendo na maioria brasileiros (62.7%) e portugueses (30.5%). Os principais motivos para a desfiliação das Testemunhas de Jeová foram: perda da fé na doutrina (26.8%), discordância ou desilusão com a liderança (14.9%) e discordância com alguns regulamentos e obrigações (11.0%). As três principais consequências da desfiliação das Testemunhas de Jeová foram: ostracismo (30.9%), problemas de saúde (26.3%) e sentimentos negativos (13.4%). O segundo estudo empírico teve como finalidade traduzir para português e encontrar evidência de validade baseada na estrutura interna e evidência convergente das pontuações da Group Psychological Abuse Scale (GPA) e da Psychological Abuse Experienced in Groups Scale (PAEGS). Não foi encontrada evidência de que a perceção de abuso psicológico em grupo seja um construto multidimensional e invariante entre grupos, nem que os dois instrumentos avaliem o mesmo construto. O terceiro estudo empírico teve como propósitos: a) calcular a prevalência da perceção de abuso psicológico em grupo em ex- -Testemunhas de Jeová em Portugal e no Brasil; b) explorar diferenças relativamente ao nível de perceção de abuso psicológico em grupo entre homens e mulheres, e entre portugueses e brasileiros ex-Testemunhas de Jeová; c) analisar uma possível relação entre a perceção de abuso psicológico em grupo em ex-membros das Testemunhas de Jeová em Portugal e no Brasil e a sensação de pertencer a esse grupo quando era membro; e d) explorar uma possível relação entre a perceção de abuso psicológico em grupo em ex-membros das Testemunhas de Jeová em Portugal e no Brasil e o nível de depressão dos mesmos. A amostra foi a mesma do primeiro estudo empírico. Verificámos que a grande maioria dos participantes percecionou as Testemunhas de Jeová como um grupo religioso abusivo (97.5% – GPA; 89.4% – PAEGS). As médias das pontuações obtidas na GPA e na PAEGS foram significativamente mais elevadas nos brasileiros do que nos portugueses. No entanto, o tamanho do efeito foi pequeno e médio, respetivamente.
- Estudo de seroprevalência de anticorpos anti-SARS-CoV-2 no concelho de MoraPublication . Costa, Mélanie Ferreira; Condinho, Mónica Sofia Leal; Sinogas, Carlos José ManaiaEm dezembro de 2019, na China, registaram-se os primeiros casos de infeção pelo novo coronavírus, que se veio a espalhar por todo o mundo pondo em causa a saú-de e a vida da humanidade. A pandemia foi declarada pela OMS a 11 de março de 2020. As estatísticas do número de casos confirmados e óbitos são ferramentas essen-ciais para monitorizar a propagação da doença, no entanto, sabe-se que não refletem o real impacto da mesma. Acontece que, um grande número de casos não é detetado por serem casos assintomáticos, paucissintomáticos ou simplesmente não serem testados. Neste contexto, os estudos de seroprevalência revelam elevada importância para estimar o número de pessoas que foram expostas ao vírus e para avaliar a proporção da população que já poderá ter desenvolvido anticorpos contra o SARS-CoV-2 numa área específica, podendo estar potencialmente protegidas contra infeções subsequentes. Os primeiros dois casos confirmados de infeção pelo SARS-CoV-2 em Portugal ocorreram a dia 1 de março de 2020, no Porto e em Lisboa. Relativamente à vila de Mo-ra situada no distrito de Évora, sabe-se que os primeiros casos identificados de COVID-19 foram registados no dia 2 de agosto de 2020. Em sequência desenvolveu-se um surto no concelho, que segundo se sabe, terá incluído 62 pessoas. Realizou-se um estudo de seroprevalência nesta população, a fim de perceber, se os indivíduos que testaram positivo desenvolveram anticorpos, dos que não testaram positivo quantos contactaram o vírus e, até que ponto a passagem do vírus levou à imu-nização da população. Para este estudo, usaram-se testes rápidos de deteção de anticor-pos anti-SARS-CoV-2 qualitativos. Participaram 272 pessoas, tendo-se registado uma idade média de 46,6 ± 18,7 anos, sendo que o género mais prevalente foi o feminino. A maioria dos participantes era de nacionalidade portuguesa e declarou-se no ativo relativamente à situação profis-sional. Concluiu-se que a maioria dos participantes que tinha testado positivo no teste RT-PCR, adquiriu imunidade que foi confirmada através da realização do teste rápido serológico e da deteção de imunoglobulinas. Além disso, também foi possível detetar participantes que provavelmente estiveram em contacto com o vírus, sem que tenham tido conhecimento. Estima-se que cerca de um terço das pessoas que contactaram o ví-rus terão sido testadas positivas para a infeção.
- Impacts of high pressure processing conditions on the microbiome of sea bass filletsPublication . Machado, Paulo Jorge Rodrigues; Power, Deborah; Pinto, Patrícia Isabel SilvestreFish and seafood products are some of the most important protein sources in human nutrition and more than 45% of the fish used for human consumption comes from aquaculture. However, fish products are easily perishable and often associated with human diseases, leading to development of different preservation methods. Recently, novel processing techniques like High Pressure Processing (HPP), that uses pressure to inactivate microbes without heat, are being optimized to extend shelf-life without affecting food quality. We used metagenomics (the global study of genetic material from environmental or organism samples) to characterize in a global way the microbes present in sea bass fillets treated with different pressures (300-600 MPa) and processing times (2-5 min) and after refrigerated storage for 1 or 11 days, contributing to optimize HPP of these products. We extracted and selected 42 DNA samples (of 14 experimental groups) based on their quantity and quality and sent them to a sequencing company to construct microbiome libraries based on the 16S rRNA gene sequencing. With the sequencing and bioinformatics analysis using QIIME it was possible to evaluate the impacts of HPP treatments on the bacterial microbiome of the samples. There was a decrease in bacterial load in the treated samples when compared to the control (confirmed by quantitative PCR of 16S), which was especially evident when we compared the control at 11 days with the treated samples at 11 days, notably in the 450MPa and 600MPa treatments. The most abundant genera of bacteria in the control fillets significantly changed after storage for 11 days, leading to a different composition to 300 MPa fillets and separated by PCoA from 450-600 MPa fillets. These had a microbiome more similar to the initial control fillets. These results will help optimizing HPP of fish fillets and identifying the main genera of deterioration bacteria and HPP effects.