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Percorrer FCT1-Teses por Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS) "02:Erradicar a Fome"
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- A Doença Celíaca e as suas comorbilidades autoimunes: Uma revisão das suas relações clínicas e estratégias terapêuticasPublication . Bernardo, Andreia Filipa Gouveia; Silva, Isabel Maria Júlio daA doença celíaca é uma doença autoimune que resulta da complexa interação entre o glúten, a suscetibilidade genética do hospedeiro e o sistema imunitário. Em indivíduos predispostos, o glúten e os péptidos resultantes da sua degradação desencadeiam uma resposta imunitária que provoca lesões na mucosa do intestino delgado com consequente atrofia das suas vilosidades. Como em qualquer outra doença autoimune, a doença celíaca tem uma forte componente hereditária, uma vez que, aproximadamente, 97% dos indivíduos com esta doença possui marcadores genéticos relacionados com o Complexo Maior de Histocompatibilidade classe II, sendo este o fator de risco genético mais importante no desenvolvimento desta enteropatia. O diagnóstico conclusivo é de extrema importância, pois permite iniciar um tratamento imediato e, desta forma, diminuir o risco de complicações da doença. O diagnóstico baseia-se na avaliação integrada dos aspetos clínicos, serológicos, genéticos e histológicos. Atualmente, a dieta isenta de glúten é a única terapêutica eficaz para esta doença. Contudo, encontram-se em estudo novas abordagens terapêuticas que podem servir de complemento à mesma. Alguns exemplos destas novas estratégias incluem terapêuticas enzimáticas orais, moduladores da permeabilidade intestinal, sequestradores de glúten, vacinação e moduladores da resposta imune. Posto isto, na presente monografia irá realizar-se uma revisão bibliográfica relativa a esta doença, onde serão abordados a fisiopatologia, etiologia, epidemiologia, diagnóstico clínico e o tratamento padrão. Adicionalmente, serão também abordadas as complicações mais prevalentes como anemia, osteoporose e doenças cardiovasculares e as novas estratégias terapêuticas. Serão, ainda, descritas as manifestações extraintestinais de origem autoimune mais prevalentes desta doença, das quais são exemplos a Diabetes Mellitus tipo 1, as doenças autoimunes da tiroide, a dermatite herpetiforme e a hepatite autoimune.
- Análise de métodos de classificação automática de uso do solo associadas à caracterização e quantificação de áreas regadas - Caso de estudo Campina de Faro, AlgarvePublication . Marques, Jonat Stefani Justa; Martins, Fernando Miguel Granja; Costa, Luís Ricardo Dias daA região Algarvia, com um clima temperado de características mediterrânicas, enfrenta uma crescente incidência de fenómenos de seca hidrológica prolongada, o que agrava de forma significativa os desafios relacionados com a escassez de recursos hídricos na região. A estimativa de valores do consumo de água subterrânea em áreas de regadio na região Algarvia consiste numa variável difícil de controlar e quantificar, não só devido ao elevado número de captações particulares, mas também por causa da variação meteorológica, que afeta os regimes de rega e das áreas regadas. Através da informação extraída pelo processamento de imagens digitais obtidas por deteção remota, juntamente com os valores das dotações de rega, pretende-se contribuir para estimativas do balanço hídrico do sistema aquífero de Campina de Faro mais precisas. Neste trabalho, estudou-se a classificação de uso e ocupação do solo para desenvolver uma metodologia de classificação automática de áreas agrícolas e espaços verdes regados, usando imagens de satélite Sentinel-2, aplicados à Campina de Faro. O projeto permitiu caracterizar com precisão as principais culturas agrícolas e espaços verdes regados na área de estudo e estimar o volume de água utilizado na rega com base nas dotações de rega das diferentes culturas. A metodologia desenvolvida é facilmente replicável para diferentes períodos e zonas, oferecendo uma ferramenta útil para a gestão dos recursos hídricos na região do Algarve. Os resultados obtidos permitiram a classificação das principais áreas e culturas regadas no sistema aquífero, bem como a quantificação da sua variação ao longo do tempo. Para além disso, foram aplicadas dotações de rega oficiais da DGADR, com o objetivo de estimar o volume de água utilizado na rega destas parcelas agrícolas, de forma a quantificar o volume de água extraído do aquífero para a agricultura e golfe. Os valores obtidos estão próximos dos valores oficiais reportados nos Planos de Gestão da Região Hidrográfica, o que demonstra, de certa forma, a fiabilidade dos resultados alcançados com esta metodologia.
- Analysis of cultural and provisioning ecosystem services use: a comparative study of artificial reefs, rocky areas, and sandy bottoms in the AlgarvePublication . Camelo, Ana Maria Madiedo; Ramos, Jorge; Leitão, FranciscoArtificial reefs are human made structures that are deployed in the seabed to provide multiple economic, social and ecological benefits. Artificial reefs have emerged as a highly effective strategy to provide ecosystem services, such as habitat protection, restoration, and recreation. Despite their acknowledged benefits, there remains a limited understanding of how these reefs are currently being used by the local communities. The present study aims to identity and analyze the use of provisioning and cultural ecosystem services provided by the artificial reefs located in the south coast of Portugal, in comparison with rocky areas and sandy bottoms. To achieve this, a satellite dataset comprising automatic identification system (AIS) records with nine months of hourly location data for recreational and fishing vessels (including purse seiners and multi-gear) was utilized to identify and analyse high-density areas. Statistical tests were conducted to further assess the data. The results indicate that, within the selected study area, sandy bottoms are the most intensively used habitat for fishing activities, with multi-gear vessels being the predominant type, proving to be a significant type of habitat that provides essential ecosystem services. In contrast, artificial reefs were found to be used for recreational and fishing activities, but with lower density values, while rocky areas were the least used ones.
- Analysis of paralytic shellfish toxins in natural samples: liquid chromatography coupled to fluorescent detection versus liquid chromatography coupled to mass spectrometryPublication . Mestizo, Ma Llorina; Silva, José Paulo da; Lage, SandraAs toxinas PSP (Paralytic Shellfish Poison), conhecidas pelos seus efeitos paralisantes, são produzidas por várias espécies de dinoflagelados marinhos e subsequentemente bioacumulam-se em bivalves filtradores. Estes bivalves tornam-se vetores para o consumo humano, podendo causar sintomas tóxicos como dormência, diarreia, náuseas e vómitos, e, em casos graves, levar à morte por paralisia respiratória. Estas toxinas são monitorizadas por diversos países para proteger a saúde pública. No entanto, algumas toxinas PSP não são monitorizadas nem regulamentadas, pois foram recentemente descobertas através de técnicas analíticas avançadas. Neste estudo, comparamos o método AOAC de cromatografia líquida com deteção por fluorescência com o método desenvolvido no nosso laboratório, que utiliza cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massa de alta resolução (LC-HRMS), seguida de extração de cromatogramas da massa exata (AMXIC) para quantificar as toxinas PSP regulamentadas e não regulamentadas. O procedimento AMXIC demonstrou ser seletivo, fornecendo perfis individuais claros tanto para toxinas regulamentadas quanto para não regulamentadas. Devido à indisponibilidade de CRMs (Certified Reference Materials) para esses análogos, foi realizada uma estimativa usando o procedimento AMXIC e a resposta ao análogo de toxina regulamentada mais semelhante. Analisaram-se extratos de amostras de mexilhão naturalmente contaminadas (Mytilus galloprovincialis) e do dinoflagelado marinho Gymnodinium catenatum utilizando os métodos mencionados. Além disso, os efeitos de matriz foram avaliados em extratos preparados com cartuchos de C18 e de carbono grafitizado, utilizando saxitoxina como composto de referência. As toxinas PSP não regulamentadas com um grupo hidroxilo no C-11, conhecidas como toxinas M, foram detetadas na amostra de mexilhão contaminado, enquanto as toxinas GC foram observadas apenas na amostra de dinoflagelado. A identificação foi feita com base nas massas exatas e nos padrões de fragmentação. No entanto, nem todas as toxinas não regulamentadas presentes nas amostras foram identificadas devido à baixa intensidade dos sinais destes analitos após fragmentação. A falta de CRMs para essas toxinas não regulamentadas limita a sua identificação. Em conclusão, o método HPLC-FLD é eficaz para triagem, especialmente em análises de rotina. No entanto, o método LC-HRMS permite uma identificação mais precisa do perfil completo das toxinas PSP nas amostras, contribuindo para uma melhor avaliação da toxicidade total.
- Blue shark distribution modelling in the North Atlantic: assessing projected overlap with longline fishing and climate change impactPublication . Dias, Carolina Mendes de Morais Gonçalves; Queiroz , Nuno Miguel Cabral; Abecasis, David Maria AguiarO tubarão azul, Prionace glauca, é uma espécie particularmente afetada pela atividade humana, não só devido à pesca de palangre, como também às alterações climáticas. Por um lado, os aumentos de temperatura provocam um afastamento de espécies marinhas dos trópicos, enquanto que a pesca de palangre contribui para o declínio populacional das espécies mais vulneráveis. O tubarão azul é uma das espécies mais abundantes e com distribuição mais abrangente dos elasmobrânquios pelágicos, e é também a espécie do grupo mais afetada pelo género de pesca referido anteriormente. Um dos fatores que contribui para este facto é a o facto da atividade pesqueira não ser regulada eficientemente no comércio do tubarão azul. Embora sejam realizados esforços para controlar a pesca não regulamentada, é praticamente impossível ter dados totalmente fidedignos quanto ao exato número de indivíduos pescados. Pelas razões supramencionadas, o impacto da pesca no tubarão azul permanece um assunto polémico. O presente estudo teve como objetivos aferir o efeito das alterações climáticas na distribuição do tubarão azul, bem como identificar as áreas nas quais os tubarões estão mais vulneráveis à pesca de palangre. No decorrer do projeto, recorrendo a dados de biotelemetria e a projeções futuras de condições climáticas, foram implementados modelos para avaliar o nível de adequação dos habitats em condições presentes e futuras, na região nordeste do Oceano Atlântico. Adicionalmente, os modelos de distribuição dos tubarões foram agrupados com os dados de monitorização da pesca, de modo a obter uma sobreposição geográfica. Num contexto de alterações climáticas, os modelos de distribuição futura do tubarão azul demonstraram cenários de redução de habitat e desvios de distribuição em algumas regiões, concordantes com os efeitos observados em outras espécies marinhas. Relativamente à vulnerabilidade à pesca, foram obtidas áreas extensas de sobreposição, tanto em cenários para o presente como para o futuro. É importante salientar que algumas zonas de elevada vulnerabilidade coincidiram com zonas de berçário, tais como a região dos Açores e a costa portuguesa. Para além das pressões atuais, é esperado que estas sobreposições se mantenham e, em certas regiões, expandam até ao fim do século, arriscando a sobre-exploração da espécie devido a uma exposição prolongada às pescas. Atendendo a este facto, foram sugeridas medidas protetoras adicionais, e.g., restrição de capturas por tamanho, de modo a evitar uma pesca insustentável da espécie. Em adição, uma melhor regulação e monitorização da pesca é crucial para obter melhores medidas de conservação do tubarão azul.
- Can bivalve selective feeding shape phytoplankton community structure in the Ria Formosa coastal lagoon?Publication . Coscollá, María Nohales; Domingues, Rita; Barbosa, Ana Maria BrancoPhytoplankton plays a vital role in aquatic ecosystems, driving primary production, carbon cycling and nutrient recycling. The impact of bivalve feeding on phytoplankton biomass and community composition has been extensively documented. Nevertheless, there is currently no published research examining the impact of bivalve grazing and its selectivity on natural phytoplankton assemblages within the Ria Formosa coastal lagoon, a region responsible for 90% of Portugal's bivalve mollusc production. The aim of this study is to evaluate the impact of grazing by Mytilus galloprovincialis on natural phytoplankton assemblages in Ria Formosa. In particular, the effects of grazing on phytoplankton biomass, abundance, community composition, and the mussel's selectivity for different phytoplankton functional groups. The abundance and composition of phytoplankton were assessed using chlorophyll a concentration and microscopy: epifluorescence for pico- and nanophytoplankton and inverted for microphytoplankton. Mussel feeding was assessed by clearance rate. The microcosm experiments revealed a significant reduction in phytoplankton abundance due to mussel grazing in March, with a consistent decline in diatom abundance across all experiments. However, no significant changes were observed in phytoplankton biomass or community structure. The estimated per capita clearance rates of M. galloprovincialis ranged from 0.82 to 4.36 L h -1 individual-1 based on total chlorophyll a concentration, 1.07 to 1.95 L h -1 individual-1 based on total phytoplankton abundance, and 0.41 to 23.63 L h -1 individual-1 1 for specific phytoplankton groups. The results indicate that mussels selectively graze diatoms without significantly affecting overall phytoplankton biomass or community composition in Ria Formosa. Given the region's ecological and economic importance, understanding bivalve selective grazing is crucial for effective ecosystem management. Further studies should investigate the long-term impacts of this grazing on phytoplankton diversity and ecosystem resilience, particularly in light of changing conditions and growing aquaculture demands.
- Cancro colorretal: A influência das componentes genética e ambiental na prevenção e progressão da doençaPublication . Quaresma, Diogo Assis; Ribeiro, VeraO cancro colorretal é uma das neoplasias mais prevalentes a nível global, resultante da interação entre a predisposição genética e fatores ambientais modificáveis. As três vias principais de carcinogénese são a instabilidade cromossómica, a instabilidade de microssatélites e o fenótipo metilador de ilhas CpG. Síndromes hereditárias como a Síndrome de Lynch, a polipose adenomatosa familiar e a polipose associada a MUTYH representam causas relevantes de suscetibilidade familiar e reforçam a importância da componente genética. Entre os fatores ambientais e comportamentais, sobressaem hábitos que aumentam o risco, incluindo uma dieta ocidental rica em carnes vermelhas e processadas, o elevado consumo de álcool, o tabagismo, o excesso de peso e o sedentarismo. Em contraste, padrões alimentares como a dieta mediterrânica, a prática regular de atividade física e a manutenção de um peso corporal saudável estão associados à redução significativa do risco. A microbiota intestinal desempenha também um papel determinante, funcionando como mediador entre a dieta, a inflamação e a produção de metabolitos que podem ser protetores ou promover a carcinogénese. A prevenção primária assenta na promoção de estilos de vida saudáveis e na redução da exposição a fatores de risco, enquanto a prevenção secundária se baseia em programas de rastreio, nomeadamente a prova de sangue oculto nas fezes e a colonoscopia, fundamentais para a deteção precoce da doença. Existe ainda interesse na quimioprevenção com agentes como a aspirina, vitamina D e glucosamina e condroitina, embora os resultados clínicos sejam ainda heterogéneos. Apesar dos avanços nas estratégias terapêuticas, é na compreensão e modificação dos fatores de risco que reside a principal oportunidade de reduzir a incidência da doença, sendo a farmacogenómica igualmente essencial para personalizar o tratamento e otimizar resultados.
- Combined effect of sous-vide and natural preservatives on shelf-life extension of mackarel (Scomber colias) filletsPublication . Parreira, Carlos António Duarte Casanova; Esteves, E.; Aníbal, J.Mackerel, Scomber colias is one the most important commercial pelagic species in Portugal and Europe, being very sought after by consumers and playing an important role inside the marine food web, being mostly found in temperate or tropical waters like open oceans, coastal regions, and some semi enclosed seas . Mackerel has become the object of study in recent years, with farming efforts using aquaculture systems being most notably localized in Nigeria and in Japan, with the objective of supplying local markets ever growing demands. It is also a very sought after species due to its high content in PUF A, however, it is also a very perishable fish due to the high content of long chain omega 3 fatty acids, making mackerel prone to oxidation leading to the development of rancidity and loss of quality. These negative traits make it imperative to find a solution , so we decided to apply sous vide cooking , to preserve sensory and nutritional quality of the fish, and to reduce the rate at which lipid oxidation reactions occur to extend its shelf life. We opted for two traditional processing and complementary methods alongside the application of sous vide cooking , a brining method, and marina t ing in olive oil and garlic , which were tested against a control group that was applied the sous vide technique to test different parameters. The sampling was done in two separate instances, instrumental (color, hardness, pH, and water activity) and physicochemical analysis (TBARS, T VN N). We obtained positive results in our test parameters . The TBARS test remains inconclusive due to the possibility of results being skewed due to the lack of sensitivity of the performed test. Even with the TBARS test being inconclusive we obtained enough data that can confirm some of the benefits of the sous vide cooking technique and the use of natural preservatives in improving shelf life of the mackerel.
- Comparative ontogeny of European Sea bass (Dicentrarchus labrax) and gilthead sea bream (Sparus aurata) using potential biomarkers of larval qualityPublication . Santos, Soraia Isabel Gonçalves dos; Power, DeborahGilthead sea bream (Sparus aurata) and European sea bass (Dicentrarchus labrax) are important aquaculture species in the Mediterranean. The hatchery production of these species is of crucial importance as it supplies the juveniles and determines the productivity and quality of the commercialized fish. The aim of the present thesis is to provide an understanding of gilthead sea bream and European sea bass larval ontogeny and the challenges faced during hatchery production. The overall goal of the project is to contribute to improve key performance indicators (KPIs) by developing molecular indicators linked to the quality of this critical production stage. To achieve the objectives, European sea bass and gilthead sea bream larvae from several production batches with four early development larval stages before the juvenile phase, were received from different hatcheries. Each batch was classified as good or bad based on skeletal malformations then larvae were prepared for molecular analysis (quantitative PCR, qPCR) to evaluate genes related to the skeleton, endocrine system, immune system, and metabolic genes. The genes used for qPCR analysis were derived from a preliminary screen of genes that clustered with “good” or “bad” batches of larva and included 9 potential candidate genes for European sea bass and 12 for Sea bream. In general, divergent expression of genes related to good and bad quality were detected at later developmental stages in the gilthead sea bream. In contrast, divergent expression of genes related to good and bad quality were detected very clearly in early to late developmental stages of European sea bass. The qPCR analysis identified 5 core quality biomarker genes strongly linked to skeletal ontogeny in Sea bream (gk, ostc, op, on and m-cad) and 2 different genes in European sea bass (try and apoa1). Further analysis on a greater number of larval production batches is required to confirm the robustness and applicability of the biomarker genes to the hatchery stage of production in industry.
- Development and optimization of seaweed cultivation in IMTAPublication . Soares, Jéni Cândido; Quintã, Raquel; Santos, RuiIn aquaculture, discharges of wastewater from fed species can lead to eutrophication of the receiving aquatic environment. The nutrient-rich wastewater can be reused in Integrated Multi-Trophic Aquaculture (IMTA), which enhances cultivation efficiency by combining species from different trophic levels to minimize waste. The macroalgae have numerous benefits, and their cultivation in aquaculture wastewater results in more sustainable and profitable aquaculture. This study involved two experiments. The first evaluated the effect of cultivation density and method (with and without substrate – 2 mm twisted nylon twine) on growth of Codium tomentosum and Halopteris scoparia under controlled conditions (18°C, light intensity of 70- 100 μmol photons m-2 s -1 , with a 12:12 photoperiod) over six weeks. The second evaluated the cultivation and bioremediation potential of H. scoparia in an IMTA system, analyzing the effect of four cultivation densities (5, 10, 15, and 20 g/L) over nine weeks. In the first experiment, both cultivation methods and species experienced significant contamination by epiphytic algae. In tumble cultivation, C. tomentosum had a higher SGR at 4 g/L, while 8 g/L had a higher average yield. H. scoparia showed higher SGR and yield at 2 g/L but greater average length at 4 g/L. Regarding substrate cultivation, according to visual observation, there may have been attachment of C. tomentosum; however, longer cultivation is required to confirm it. In contrast, H. scoparia did not demonstrate attachment or development of new individuals from spores. In H. scoparia cultivation within an IMTA system, the lowest densities (5 and 10 g/L) had the highest average SGR and yield but also a higher presence of epiphytic algae, potentially explaining the increased values. These densities also showed significantly higher N-yield. In contrast, the higher densities (15 and 20 g/L) had a significantly higher C:N ratio, suggesting nitrogen limitations that may have affected growth.